计算化学公社

标题: 求助molclus生成的二聚体文件如何导入到Multiwfn中进行Ncl分析 [打印本页]

作者
Author: 探索者 时间: 2022-11-1 21:47
标题: 求助molclus生成的二聚体文件如何导入到Multiwfn中进行Ncl分析
新手，刚刚接触量化，想按照Multiwfn教程计算一下自己研究体系，请大家广施援手，带我进入量化计算的大门
思路是通过molclus筛选二聚体，导入到Multiwfn中进行ncl分析
使用molclus生成的二聚体文件（xyz格式）如何导入到Multiwfn中进行Ncl分析
6
Generated by Multiwfn
O    0.168447 -0.205283 1.537722
H -0.356181 -0.998407 1.703817
H -0.427712 0.516174 1.774290
O    0.561453 0.382469 -1.584152
H -0.096240 0.719285 -2.205332
H    0.150233 -0.414238 -1.226346
通过molclus生成了水的二聚体（xyz文件），如何通过xyz文件进行ncl分析呢？

作者
Author: 牧生 时间: 2022-11-1 21:52
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... &highlight=igmh

强推igmh，美滋滋

作者
Author: 探索者 时间: 2022-11-1 21:59

牧生发表于 2022-11-1 21:52
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=28147&highlight=igmh

好的，非常感谢。因为刚刚接触量化，所以想重复一下别人ncl分析的工作，所以才有这个疑问

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-2 08:42
如果已经有优化后的结构，做个单点计算得到波函数文件，然后给Multiwfn分析，下文写明了
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379（http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html）

之后的分析，把上面的人提到的博文里提到的IGMH教程看一遍自然就会了。用下文的IRI也可以，只不过没法自定义片段来便利地将片段内和片段间的进行区分，看
使用IRI方法图形化考察化学体系中的化学键和弱相互作用
http://sobereva.com/598（http://bbs.keinsci.com/thread-23457-1-1.html）

如今已经没什么理由用NCI了。IRI能同时展现化学键作用，是NCI做不到的。IGMH能便利地划分片段、直观考察原子和原子对的参与情况，也是NCI做不到的。

作者
Author: 探索者 时间: 2022-11-2 08:54

sobereva 发表于 2022-11-2 08:42
如果已经有优化后的结构，做个单点计算得到波函数文件，然后给Multiwfn分析，下文写明了
详谈Multiwfn支持 ...

好的，我再认真学习学习，谢谢sob老师

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)