计算化学公社

标题: 请问：非平面的分子轨道计算有要求吗？我算出来的分子由于取代基原因非平面，做不出图 [打印本页]

作者
Author: Jianggggg-rj 时间: 2022-11-3 08:37
标题: 请问：非平面的分子轨道计算有要求吗？我算出来的分子由于取代基原因非平面，做不出图
分子由于取代基原因非平面，绘制轨道图时总是无法读取文件，麻烦各位老师解答一下。
另：此分子还要做ESP图，请问非平面会不会对ESP图有影响

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-3 09:04
跟是否平面根本毫无联系，不知道你怎么想的

任意类型分子都可以按下文看轨道、绘制静电势图
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269（http://bbs.keinsci.com/thread-462-1-1.html）
用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法（含演示视频）
http://sobereva.com/449（http://bbs.keinsci.com/thread-11550-1-1.html）
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示）
http://sobereva.com/443（http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html）
绘制静电势全局极小点+等值面图展现孤对电子位置的方法
http://sobereva.com/493（http://bbs.keinsci.com/thread-13638-1-1.html）

作者
Author: Jianggggg-rj 时间: 2022-11-3 09:14

sobereva 发表于 2022-11-3 09:04
跟是否平面根本毫无联系，不知道你怎么想的

任意类型分子都可以按下文看轨道、绘制静电势图

我之前看轨道是使用Chemcraft看轨道，此分子用Chemcraft软件看不成，请问老师这个分子只能用Multiwfn作图吗

作者
Author: 易振宇1996 时间: 2022-11-3 09:50

Jianggggg-rj 发表于 2022-11-3 09:14
我之前看轨道是使用Chemcraft看轨道，此分子用Chemcraft软件看不成，请问老师这个分子只能用Multiwfn作图 ...

https://www.zhihu.com/zvideo/1265546647359860736
Gaussview也可以画ESP

作者
Author: Jianggggg-rj 时间: 2022-11-3 12:44

易振宇1996 发表于 2022-11-3 09:50
https://www.zhihu.com/zvideo/1265546647359860736
Gaussview也可以画ESP

你好，ESP可以做出来，只有轨道，每次在Chemcraft看轨道都是不能读取该文件

作者
Author: pwzhou 时间: 2022-11-3 13:04
看轨道的话先把chk文件转换为fchk文件，然后再用chemcraft打开fchk文件。如果想用输出文件看轨道，那需要额外的关键词。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-11-3 13:42

Jianggggg-rj 发表于 2022-11-3 05:44
你好，ESP可以做出来，只有轨道，每次在Chemcraft看轨道都是不能读取该文件

那肯定是因为平面性以外的原因，诸如版本不兼容、文件损坏等。
不要毫无根据地从分子结构归纳报错原因

作者
Author: Jianggggg-rj 时间: 2022-11-3 17:09

wzkchem5 发表于 2022-11-3 13:42
那肯定是因为平面性以外的原因，诸如版本不兼容、文件损坏等。
不要毫无根据地从分子结构归纳报错原因

别的轨道都可以打开，请问如果是文件损坏原因，要怎么修复文件

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-11-3 20:42

Jianggggg-rj 发表于 2022-11-3 10:09
别的轨道都可以打开，请问如果是文件损坏原因，要怎么修复文件

先用文本编辑器打开文件，跟之前可以正常打开的文件比较，找不同。

作者
Author: pwzhou 时间: 2022-11-3 21:25

Jianggggg-rj 发表于 2022-11-3 17:09
别的轨道都可以打开，请问如果是文件损坏原因，要怎么修复文件

你这个截图里打开的是log文件，你用fchk文件看轨道，肯定不会有问题。

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