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标题: 求助：水-辛酸两相体系计算LINCS报错 [打印本页]

作者
Author: xjtu_zk 时间: 2022-11-3 16:10
标题: 求助：水-辛酸两相体系计算LINCS报错
本帖最后由 xjtu_zk 于 2022-11-3 16:20 编辑

各位前辈，体系如图，中间是4*4*11nm的辛酸盒子，两边是4*4*20的水盒子： (, 下载次数 Times of downloads: 8)
mdrun过程中，加上-ntmpi 1 -ntomp 64 会计算中止，出现以下界面：
(, 下载次数 Times of downloads: 9)
不加-ntmpi 1 -ntomp 64，会出现以下报错：
(, 下载次数 Times of downloads: 5)
问题出现的很奇怪，之前计算4*4*11nm的辛酸盒子，两边是4*4*10的水盒子，就可以正常计算，同一台机器，同一个软件版本。

附上输入文件，希望得到解答，谢谢！
(, 下载次数 Times of downloads: 4)

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-4 08:26
仔细看http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8

在先确保拓扑文件合理的前提下，减小步长、加大初始结构中分子间距等等，都是上文提过的

作者
Author: xjtu_zk 时间: 2022-11-4 09:36

sobereva 发表于 2022-11-4 08:26
仔细看http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8

在先确保拓扑文件合理的前提下，减小步长、加大初始结构中 ...

好的谢谢社长

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