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标题: 构建ONIOM模型对分子进行固定问题 [打印本页]

作者
Author: a-Student 时间: 2022-11-5 11:27
标题: 构建ONIOM模型对分子进行固定问题
各位老师，打扰一下，请教两个问题：1.固体分子构建ONIOM模型的时候，是否可以对layer层所有分子进行固定优化结构并计算光谱么？如果固定了以电子嵌入来计算时候会考虑layer层分子的作用么？
2.gaussian在计算的时候会对固定的分子进行计算么？
麻烦各位老师了，谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-6 11:13
1 问题语义不明。说清楚你所谓的“layer层”指什么

2 固定的分子只不过几何优化不移动、计算Hessian时不考虑其对应的对角元和非对角元，其它的照常算

作者
Author: a-Student 时间: 2022-11-6 17:36

sobereva 发表于 2022-11-6 11:13
1 问题语义不明。说清楚你所谓的“layer层”指什么

2 固定的分子只不过几何优化不移动、计算Hessian时不 ...

谢谢老师，两层ONIOM模型是High层不固定，将剩下的low层全部固定上，因为我看有的文章是这样分析的，但是不确定这样算光谱和分析电子性质是否准确。再次麻烦您

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-7 10:09

a-Student 发表于 2022-11-6 17:36
谢谢老师，两层ONIOM模型是High层不固定，将剩下的low层全部固定上，因为我看有的文章是这样分析的，但是 ...

low层位置合理的话，对high层优化后，计算吸收光谱、做电子结构分析就没问题。但是low层初始位置若不合理就不行。而且如果是对high层做激发态优化，也必须考虑low层中相邻原子的弛豫效应。

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