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标题: 求助使用Multiwfn+VMD进行AIM分析,在VMD里输入aim提示无法读取CPs.pdb文件 [打印本页]

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18598718812    时间: 2022-11-5 22:19
标题: 求助使用Multiwfn+VMD进行AIM分析,在VMD里输入aim提示无法读取CPs.pdb文件
老师您好,我已经按照《使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示)》该文的步骤,成功对AIM.bat进行了具体的编辑,如图 (, 下载次数 Times of downloads: 7) ,然后AIM.txt和AIM.vmd与vmd.rc也按照该文章设置好了。然后双击AIM.bat脚本,成功得到了CPs.pdb、mol.pdb、paths.pdb等文件。但是出现了一个问题,按照文章,理论上现在启动VMD输入aim回车便可以得到AIM图,但是我启动VMD输入aim后却显示,无法读取CPs.pdb文件,如图[attach]58319[/attach]。且这三个pdb文件是正常文件,直接拖入VMD可以使用。请问老师这是什么原因,该怎么解决呢?
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sobereva    时间: 2022-11-6 09:45
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “使用Multiwfn+VMD快速进行AIM分析” 改了,以后务必注意,下次将删帖+扣分处理。
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sobereva    时间: 2022-11-6 10:18
别把VMD装到默认路径下,此目录又有空格,又可能没有权限在里面创建新文件,自找麻烦
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18598718812    时间: 2022-11-6 16:36
sobereva 发表于 2022-11-6 09:45
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出 ...

谢谢老师的回复,我下次发帖一定注意规则。
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18598718812    时间: 2022-11-6 16:36
sobereva 发表于 2022-11-6 10:18
别把VMD装到默认路径下,此目录又有空格,又可能没有权限在里面创建新文件,自找麻烦

那我现在尝试下,将VMD安装在非默认路径下,谢谢老师。
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18598718812    时间: 2022-11-6 19:43
sobereva 发表于 2022-11-6 10:18
别把VMD装到默认路径下,此目录又有空格,又可能没有权限在里面创建新文件,自找麻烦

老师,我重新安装的VMD1.9.3老一版本在非默认地址的。配置完成之后在VMD输入aim提示无法读取AIM.vmd文件该怎么解决呢?
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sobereva    时间: 2022-11-7 10:16
18598718812 发表于 2022-11-6 19:43
老师,我重新安装的VMD1.9.3老一版本在非默认地址的。配置完成之后在VMD输入aim提示无法读取AIM.vmd文件 ...

没恰当配置vmd.rc文件,或者脚本文件不在VMD目录下
搞清楚博文里每一个操作的用意、每一个文件的用处、脚本里每行语句的含义,自然就知道怎么回事了
使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示)
http://sobereva.com/445http://bbs.keinsci.com/thread-11079-1-1.html

连视频都提供了,没法解释得更清楚了




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