计算化学公社

标题: 请教结合能和结合自由能计算值正负的问题 [打印本页]

作者
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junhaowang    时间: 2022-11-6 22:21
标题: 请教结合能和结合自由能计算值正负的问题
本帖最后由 junhaowang 于 2022-11-6 22:26 编辑

各位老师好,我在计算A+2B→AB2的结合能和结合自由能时出现如下问题。(1)使用B3LYP-D3/6-311G*A、B和AB进行结构优化和频率计算,然后使用M06-2X-D3/Jul-cc-pvtz对优化的结构进行单点能计算。根据公式ΔE=E(AB2)-E(A)-2E(B),得到的ΔE为负值,见图1。
(2)计算结合自由能时,将M06-2X-D3/Jul-cc-pvtz级别下得到的单点能(E)加上B3LYP-D3/6-311G*级别下的Gcorr得到G。根据公式ΔG=G(AB2)-G(A)-2G(B),得到的ΔG为正值,见图2。
(3)使用Sob老师提出的Shermo程序,并严格按照http://sobereva.com/552提供的教程进行计算,根据公式ΔG=G(AB2)-G(A)-2G(B),ΔG结果为正值,与图2值近似。
烦请老师们帮忙解答,谢谢。
(, 下载次数 Times of downloads: 14) 图1

(, 下载次数 Times of downloads: 13)
图2





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chands    时间: 2022-11-6 22:42
化合反应一般是熵减过程,delta S为负,是有可能delta E为负但delta G为正。
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junhaowang    时间: 2022-11-7 09:59
chands 发表于 2022-11-6 22:42
化合反应一般是熵减过程,delta S为负,是有可能delta E为负但delta G为正。

老师你好,ΔG为正值就意味着非自发反应,就没法通过计算结合自由能来说明A与B的结合反应了是吧?
作者
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sobereva    时间: 2022-11-7 10:38
junhaowang 发表于 2022-11-7 09:59
老师你好,ΔG为正值就意味着非自发反应,就没法通过计算结合自由能来说明A与B的结合反应了是吧?

可以讨论deltaG怎么受温度影响,特定温度以上为正,不能自发结合;特定温度以下为负,能结合

我的这篇文章有一部分研究了OPP与18碳环结合的温度依赖性问题,可以参考:
18碳环与oligoparaphenylene (OPP)形成的新颖的双马达纳米转子复合物的量子化学和分子动力学研究:Zeyu Liu,* Xia Wang, Tian Lu,* et al., Novel dual-motor nanorotator assembled by cyclo[18]carbon and figure-eight carbon hoop, ChemRxiv (2022) DOI: 10.26434/chemrxiv-2022-lb0dt

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junhaowang    时间: 2022-11-7 10:50
sobereva 发表于 2022-11-7 10:38
可以讨论deltaG怎么受温度影响,特定温度以上为正,能自发结合;特定温度以下为负,不能结合

我的这篇 ...

谢谢Sob老师,我看一下您的文章。




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