计算化学公社

标题: 请问怎么对IGMH结果中的氢键和范德华吸引作用定量分析？ [打印本页]

作者
Author: yang2020 时间: 2022-11-7 00:53
标题: 请问怎么对IGMH结果中的氢键和范德华吸引作用定量分析？
Sob老师以及论坛中的各位老师晚上好，最近我使用IGMH分析了吸附主客体之间的作用类型，得到了蓝绿色等值面图。我认为蓝色是氢键作用，绿色是范德华吸引，这是从肉眼定性分析得到的，我想问的是可以定量地分析出这两种相互作用所占的比例吗？ (, 下载次数 Times of downloads: 15)

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-11-7 02:12
这个一般要靠能量分解分析。至于有没有办法纯粹从IGMH结果做定量分析我就不清楚了，但估计即使这种方法存在也不如用能量分解分析的做法更普遍

作者
Author: 牧生 时间: 2022-11-7 08:25
氢键，范德华作用，并没有严格的界限，很弱的氢键，在igmh分析中，也可能表现为绿色，只要长度和角度符合氢键时，也认为是氢键。
你这个图中，是吸引力，不用看边缘的绿色

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-7 10:04
不要过度解释边缘的绿色区域。那是因为那种地方电子密度很低所以才显示出绿色，显然当前要关注的是相互作用轴线区域的颜色
这是典型的氢键，相对于氢键来说范德华作用完全可以忽略不计

另外，强烈建议参看此文里的讨论
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度：一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
http://sobereva.com/513（http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html）

作者
Author: yang2020 时间: 2022-11-7 11:05

wzkchem5 发表于 2022-11-7 02:12
这个一般要靠能量分解分析。至于有没有办法纯粹从IGMH结果做定量分析我就不清楚了，但估计即使这种方法存在 ...

谢谢老师解答

作者
Author: yang2020 时间: 2022-11-7 11:06

sobereva 发表于 2022-11-7 10:04
不要过度解释边缘的绿色区域。那是因为那种地方电子密度很低所以才显示出绿色，显然当前要关注的是相互作用 ...

嗯呐，谢谢sob老师解答

作者
Author: yang2020 时间: 2022-11-7 11:07

牧生发表于 2022-11-7 08:25
氢键，范德华作用，并没有严格的界限，很弱的氢键，在igmh分析中，也可能表现为绿色，只要长度和角度符合氢 ...

谢谢老师解答

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