计算化学公社

标题: 研究质子在离聚物中的传输问题,反应性力场EVB实现软件请教 [打印本页]

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芝士栗子小甜饼    时间: 2022-11-7 19:57
标题: 研究质子在离聚物中的传输问题,反应性力场EVB实现软件请教
各位老师好,我最近在研究质子在离聚物中的传输问题,想使用反应性力场EVB对于质子的Grotthuss传输进行研究,但我根据文献下载了DL_POLY软件之后,却没有找到实现EVB的功能。希望有老师能够对于DL_POLY在EVB反应力场的使用有一些指导。或者有其他能够实现EVB反应力场的软件,谢谢老师们。

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sobereva    时间: 2022-11-8 13:10
AMBER也有EVB功能
如今来说,用CP2K跑AIMD研究这种问题或许是更好选择
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芝士栗子小甜饼    时间: 2022-11-8 14:25
sobereva 发表于 2022-11-8 13:10
AMBER也有EVB功能
如今来说,用CP2K跑AIMD研究这种问题或许是更好选择

谢谢sob老师的回复,使用EVB主要是考虑到我无法在保证研究有意义的情况下将我的体系压缩到200-300个原子。还考虑过用反应性力场ReaxFF来实现这个目的,但做了一些test发现他对于我研究的体系的描述并不是很正确。我会研究一下AMBER在EVB的应用。还想请问老师一个问题,老师为什么会建议我使用AIMD呢?是因为大家对于EVB的认可度不是很高吗?
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sobereva    时间: 2022-11-9 12:13
芝士栗子小甜饼 发表于 2022-11-8 14:25
谢谢sob老师的回复,使用EVB主要是考虑到我无法在保证研究有意义的情况下将我的体系压缩到200-300个原子 ...

我对EVB没太关注
AIMD又省事又主流认可度又高,随着计算机运算能力的发展,很多传统的经验性较强的技术都被取代了
对于目前主流的双路服务器,CP2K结合纯泛函跑AIMD绝不仅限于300个原子,翻倍都没压力(100ps以内尺度来说)。如果用GFN-xTB,上千原子都没压力。在超算上,CP2K都已经能做到一亿原子的GFN-xTB的动力学了,见Parallel Computing 111 (2022) 102920。

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芝士栗子小甜饼    时间: 2022-11-9 16:53
sobereva 发表于 2022-11-9 12:13
我对EVB没太关注
AIMD又省事又主流认可度又高,随着计算机运算能力的发展,很多传统的经验性较强的技术 ...

谢谢老师的指导




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