计算化学公社

标题: orca计算大分子结构不收敛 [打印本页]

作者
Author: tsgyls 时间: 2022-11-8 17:21
标题: orca计算大分子结构不收敛
本帖最后由 tsgyls 于 2022-11-8 17:19 编辑

计算了一个134个C，115个H，7个N，1个O的分子（结构不能放上来），但是不收敛。报错为
(, 下载次数 Times of downloads: 13)

输入的是
!B3LYP/G cc-pVDZ D3BJ Grid5 TightSCF TightOpt NORI slowconv
!Opt
!NumFreq
%pal nprocs 36
end
%scf
MaxIter 200
MaxDisk 5000
MaxIntMem 10000
end

一开始以为是内存的原因，将核数改为18，MaxIntMem改为20000，但依然出现相同的报错。
不知道哪里出现了问题，恳请各位老师帮忙看看

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-11-8 17:29
你是不是用mpirun提交的orca？不能那么提交。
这个输出文件明显是你启动了好多个独立的orca进程，都往一个输出文件里写文件（所以出现了好几次第0次迭代，然后又有好几次第1次迭代），不同进程打架了。

作者
Author: tsgyls 时间: 2022-11-8 19:41

wzkchem5 发表于 2022-11-8 17:29
你是不是用mpirun提交的orca？不能那么提交。
这个输出文件明显是你启动了好多个独立的orca进程，都往一个 ...

谢谢老师提醒，我试着改成nprocs 1就正常了。
我还想问的是如果我想用多核，那该怎么提交

作者
Author: aofchas 时间: 2022-11-8 19:55

tsgyls 发表于 2022-11-8 19:41
谢谢老师提醒，我试着改成nprocs 1就正常了。
我还想问的是如果我想用多核，那该怎么提交

应该是linux吧用orca完整路径提交 /home/user/.../orca文件夹/orca 在orca的inp文件里面设置核心数和内存数这里的核心数是物理核心数不是逻辑核心数

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-11-8 20:11

tsgyls 发表于 2022-11-8 12:41
谢谢老师提醒，我试着改成nprocs 1就正常了。
我还想问的是如果我想用多核，那该怎么提交

orca说明书里写了。
有的程序是用mpirun -np xx program_name这样的方式提交并行任务的，但是orca提交并行任务和提交串行任务的命令完全一样，不需要且不能写mpirun，因为是orca自己调用mpirun，而不是mpirun调用orca。唯一体现并行和串行的区别的地方就是输入文件里的nprocs

作者
Author: tsgyls 时间: 2022-11-8 20:19

wzkchem5 发表于 2022-11-8 20:11
orca说明书里写了。
有的程序是用mpirun -np xx program_name这样的方式提交并行任务的，但是orca提交并 ...

明白了，谢谢老师

作者
Author: tsgyls 时间: 2022-11-8 20:21

aofchas 发表于 2022-11-8 19:55
应该是linux吧用orca完整路径提交 /home/user/.../orca文件夹/orca 在orca的inp文件里面设置核心数和内 ...

好的，谢谢

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)