计算化学公社

标题: pi电子显示问题 [打印本页]

作者
Author: 17853462014 时间: 2022-11-9 15:45
标题: pi电子显示问题
老师您好，我用《在Multiwfn中单独考察pi电子结构特征》（http://sobereva.com/432）里的方法对Graphene/MoS2进行了显示Π轨道的操作，发现石墨烯正常显示pi电子轨道，但是S原子外围也有显示，这证明S原子上有pi轨道还是只是单纯的离域性比较强的电子呢？ (, 下载次数 Times of downloads: 12)

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-9 15:50
那是默认的pi轨道判断阈值下的误判所致，直接无视。通过调整判断阈值也可以消除（仔细看博文里提到的我的TCA原文里的算法介绍）。凭常识就知道那些硫不可能参与pi共轭

作者
Author: 17853462014 时间: 2022-11-9 16:00

sobereva 发表于 2022-11-9 15:50
那是默认的pi轨道判断阈值下的误判所致，直接无视。通过调整判断阈值也可以消除（仔细看博文里提到的我的TC ...

好的，谢谢老师。我主要一开始发现这个堆叠结构结合能里色散作用占比非常大，我考虑到是石墨烯上离域的pi电子的原因，就试了一下。后来观察MoS2的共价键结构，发现S原子在跟Mo原子形成共价键后也有一个相对自由的电子在外围，这是不是就是显示的那个电子的轨道啊？色散作用之所以在结合能中占比大是每个S上这个自由度比较大的电子与石墨烯上的pi电子共同影响的吗？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-11-9 23:40

17853462014 发表于 2022-11-9 09:00
好的，谢谢老师。我主要一开始发现这个堆叠结构结合能里色散作用占比非常大，我考虑到是石墨烯上离域的pi ...

对，简单来说，-2价硫的极化率很大，石墨烯的极化率也很大，由Casimir-Polder公式易知两个极化率很大的体系之间的色散作用必然大

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-10 11:18

17853462014 发表于 2022-11-9 16:00
好的，谢谢老师。我主要一开始发现这个堆叠结构结合能里色散作用占比非常大，我考虑到是石墨烯上离域的pi ...

“相对自由的电子在外围” 用Multiwfn画个ELF图就能看得很清楚。你当前的图也能说明，这体现的是S的孤对电子轨道，对色散作用有显著贡献。

作者
Author: 17853462014 时间: 2022-11-10 12:30

wzkchem5 发表于 2022-11-9 23:40
对，简单来说，-2价硫的极化率很大，石墨烯的极化率也很大，由Casimir-Polder公式易知两个极化率很大的体 ...

好的，多谢。

作者
Author: 17853462014 时间: 2022-11-10 12:31

sobereva 发表于 2022-11-10 11:18
“相对自由的电子在外围” 用Multiwfn画个ELF图就能看得很清楚。你当前的图也能说明，这体现的是S的孤对 ...

好的，谢谢老师。

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