计算化学公社

标题: 原子选择问题，无法进行原子选择。 [打印本页]

作者
Author: 熊小熊 时间: 2022-11-9 16:45
标题: 原子选择问题，无法进行原子选择。
大家好，我想请教一下，在VMD中导入pdb文件，想要对不同原子类型呈现不同的形态，但是在进行原子选择时，始终出现如下的问题，想请教一下这是那个地方除了问题呢？谢谢！

作者
Author: snljty2 时间: 2022-11-9 19:47
看手册，选区不是这么写的。如果元素名，比如element P。就是你那两个框的内容都得点。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-10 14:43
仔细看此文
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

还得注意仅当你的pdb里记录了元素信息时才能用element P，看
在VMD程序里对不同元素的原子用不同颜色显示的方法
http://sobereva.com/624（http://bbs.keinsci.com/thread-26306-1-1.html）

作者
Author: 熊小熊 时间: 2022-11-11 20:41

snljty2 发表于 2022-11-9 19:47
看手册，选区不是这么写的。如果元素名，比如element P。就是你那两个框的内容都得点。

好的，谢谢！

作者
Author: 熊小熊 时间: 2022-11-11 20:42

sobereva 发表于 2022-11-10 14:43
仔细看此文
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14 ...

好的，谢谢老师。

作者
Author: chen0201 时间: 2022-11-16 12:01
请问你解决了吗，我也是这个问题，并且换成了name 和element也不行

作者
Author: 熊小熊 时间: 2022-11-16 17:06

chen0201 发表于 2022-11-16 12:01
请问你解决了吗，我也是这个问题，并且换成了name 和element也不行

这个选择要根据你自己的体系组成选择，你多尝试几次，我也表述不出来，想选择某一类原子，确实不好弄。

作者
Author: chen0201 时间: 2022-11-18 15:34

熊小熊发表于 2022-11-16 17:06
这个选择要根据你自己的体系组成选择，你多尝试几次，我也表述不出来，想选择某一类原子，确实不好弄。

你选择的原子数多吗，就是我选择的第一类和第二类原子都有很多个，是不是这个原因呢？

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