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标题: MOPAC结果查看 [打印本页]

作者
Author: 九尾肥狐狸 时间: 2016-5-26 16:25
标题: MOPAC结果查看
本帖最后由九尾肥狐狸于 2016-5-26 16:25 编辑

老师您好，我想用MOPAC对大体系做初步优化来选取一些最优构型，然后用DFT方法作进一步优化。先用gview搭建结构，再将.gjf文件用高斯转换成MOPAC文件。做完优化之后，我需要优化好的结构和能量，MOPAC程序输出的.out文件不能直接用gview观看。我把.out文件中位于能量后面、特征向量前面的笛卡尔坐标用文本文件编辑，去掉编号加上高斯文件的开头部分，改成.gjf文件就能用givew看结构了。这个结构是优化好的构型吗？

我的.inp文件对吗？ FINAL HEAT OF FORMATION 这个是生成焓，TOTAL ENERGY和 ELECTRONIC ENERGY分别代表的是什么呢？

谢谢老师，辛苦了。

作者
Author: sobereva 时间: 2016-5-26 16:39
你要看优化轨迹或最终结构，强烈推荐用mopac2xyz+VMD实现，见
将MOPAC2012的几何优化过程转换为xyz轨迹文件的小工具
http://sobereva.com/212
把优化输出文件用mopac2xyz转换成.xyz轨迹，拖到VMD里，就能看优化轨迹动画，最后一帧就是最终结构，然后可以保存结构

TOTAL ENERGY和 ELECTRONIC ENERGY不用管，官方都说这没什么确切意义。

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