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标题: 请教个slurm脚本的问题 [打印本页]

作者
Author: alwens 时间: 2022-11-14 19:53
标题: 请教个slurm脚本的问题
由于先后不同年代买的机器，现在做在一个集群里面。有的36核心，有的56，有的64，有的128核心，由于要给学生用，这种64核心或者128的肯定要拆成2个。不知道有无办法在不指定核心数的情况下判断超过56核心就自动分配成2个作业？就是64核心或者128核心的只能提交2个作业到一个节点上。我现在是通过
#SBATCH --exclusive

独占一个节点方法避免每次都要指定核心数，但这样128核心提交就只能一个作业了，太浪费了。不知道有无什么好的办法，我查过很多文件也不行。

作者
Author: abin 时间: 2022-11-14 21:11
srun -n XX app
XX是整数，用来定义number of cpu cores.
区分大小写。

作者
Author: alwens 时间: 2022-11-14 21:24

abin 发表于 2022-11-14 21:11
srun -n XX app
XX是整数，用来定义number of cpu cores.
区分大小写。

谢谢，也就是不能自动，只能手工了

作者
Author: abin 时间: 2022-11-14 21:39

alwens 发表于 2022-11-14 21:24
谢谢，也就是不能自动，只能手工了

你要自动什么呀？

使用队列调度，
最简单模式下，用户就只能要几个核心配置多少内存。

剩下的事情，调度器会自动把任务派送到不同的机器上去。

用户根据实际计算需要，
声明处理器数目和内存需求，
剩下都自动执行了。

当然，用128核心跑高斯的老铁也有的是……
如果是计算要付费，估计账单不少，完成的计算不多。

作者
Author: alwens 时间: 2022-11-14 22:13

abin 发表于 2022-11-14 21:39
你要自动什么呀？

使用队列调度，

我是想128核心的只能提交64核心的2个作业。不知道在哪里设置。不能到时候人为提交的时候改。是在slurm里面设置

作者
Author: abin 时间: 2022-11-14 22:44

alwens 发表于 2022-11-14 22:13
我是想128核心的只能提交64核心的2个作业。不知道在哪里设置。不能到时候人为提交的时候改。是在slurm里 ...

我的方案仅供参考，
要么修改sbatch srun，前面加上判断。

要么创建不同的队列……这样不佳，还需指定队列。

给srun等套壳比较适合。

别的解决方案，我不晓得。
欢迎其他客官补充。

作者
Author: pwzhou 时间: 2022-11-15 07:55
本帖最后由 pwzhou 于 2022-11-15 07:56 编辑

给你提供一个思路，首先将这些机器按照不同的核心数分成不同的队列，比如36就是n36，56就是n56等等，然后对需要限制的队列，在/etc/slurm/slurm.conf里面，设置一个QOS，比如：
PartitionName=n64 Nodes=cn0[77-86] MaxTime=INFINITE DisableRootJobs=YES QOS=n64 State=UP
这样，然后对n64这个QOS做一个限制，
sacctmgr modify qos n64 set MaxTRESPerJob=cpu=32
这样的话，就限制了这个队列单个作业的最大核数是32，超过32的会自动挂起永不运行，直到你更改了QOS的MaxTRESPerJob。

要是你想限制只能两个32的，那就再限制：sacctmgr modify qos n64 set MinTRESPerJob=cpu=32
这样把最大和最小都设置成32，那就只能提交32核的了。

作者
Author: alwens 时间: 2022-11-15 15:52

pwzhou 发表于 2022-11-15 07:55
给你提供一个思路，首先将这些机器按照不同的核心数分成不同的队列，比如36就是n36，56就是n56等等，然后对 ...

谢谢指导，我测试下。

作者
Author: iwait 时间: 2023-3-2 13:38
请问找到解决方法了吗？

我有个旁门左道，128核的装两个虚拟机，每个64核。不然只能提交任务的时候不请求全部的核心。

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