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标题: 求助Gaussian中使用B3LYP与UHF得到的自旋密度差异 [打印本页]

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qiqi7    时间: 2022-11-15 17:03
标题: 求助Gaussian中使用B3LYP与UHF得到的自旋密度差异
各位老师好!我在进行自由基反应相关计算时,首先使用Gaussian,级别为UB3LYP-D3(bj)/6-311+G(d,p)优化中间的一些结构(单重态,C14H10),并使用stable=opt检验波函数已经稳定,且<S**2>为0是闭壳层体系,符合本人预期。接下来我使用Gaussian读取上一步的优化结构,级别为UHF/cc-pVQZ去得到稳定的波函数,预备作为orca高精度单点能的初猜。两个计算结束后,我将两个fch文件读入Multiwfn检查自旋密度图,此时发现两个级别下的自旋密度图存在的不小差异,请问造成这种事情的原因可能有哪些,该如何解决?

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wzkchem5    时间: 2022-11-15 17:19
HF因为没有相关项,会高估波函数发生对称性破缺的概率(倾向于让波函数发生自旋对称性破缺降低能量,来弥补相关能的缺失)。所以当UHF自旋破缺而UDFT不破缺时,一般后者更能代表真实的电子结构
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qiqi7    时间: 2022-11-15 17:25
wzkchem5 发表于 2022-11-15 17:19
HF因为没有相关项,会高估波函数发生对称性破缺的概率(倾向于让波函数发生自旋对称性破缺降低能量,来弥补 ...

感谢老师解答!请问这种情况是否就可以理解为,该结构是闭壳层态的,当我要使用gaussian计算HF波函数作为orca的初猜时,应该使用RHF波函数?
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qiqi7    时间: 2022-11-15 17:26
wzkchem5 发表于 2022-11-15 17:19
HF因为没有相关项,会高估波函数发生对称性破缺的概率(倾向于让波函数发生自旋对称性破缺降低能量,来弥补 ...

另外,请问老师有相关文献推荐吗?想多了解一些
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wzkchem5    时间: 2022-11-15 20:09
qiqi7 发表于 2022-11-15 10:25
感谢老师解答!请问这种情况是否就可以理解为,该结构是闭壳层态的,当我要使用gaussian计算HF波函数作为 ...

取决于你用orca做什么计算。
如果是DFT(包括双杂化泛函),那orca用什么泛函高斯就用什么泛函,如果高斯没有这个泛函就用相近泛函代替;
如果是CCSD(T),那么用UHF一般稍好一些,因为UCCSD(T)满足size consistency而RCCSD(T)不满足。但假如你不研究键解离等问题,那RHF也未必错误。
如果是DLPNO-CCSD(T),个人建议用RHF,因为DLPNO-CCSD(T)暂时不支持以broken symmetry态为参考态,虽然程序也给你算,但是结果和RCCSD(T)相似。所以不如一开始就用RHF参考态。

另外说实话,这种分子建议直接用orca算。绝对不要把“用高斯收敛以后作为orca的初猜”作为默认方法,orca的SCF收敛并不差,尤其从orca 5.0开始更是如此。即使orca 5.0收敛的概率真的仍然不如高斯高(目前没见到有人测过),你先用高斯再用orca的话,等于是一定要跑至少两个计算(还要中间转化一次文件格式),直接用orca倒有很大概率是一次计算可以收敛,其实平均上讲用高斯准备初猜很可能反倒浪费时间。
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qiqi7    时间: 2022-11-15 20:55
wzkchem5 发表于 2022-11-15 20:09
取决于你用orca做什么计算。
如果是DFT(包括双杂化泛函),那orca用什么泛函高斯就用什么泛函,如果高 ...

感谢老师的解答。因为结构较多,我是想用DLPNO-CCSD(T)计算,然后计算单点能过程中,大多数分子能量合理,对于UB3LYP下<S**2>值大于0的体系出现了明显不合理的结果,所以才尝试使用gaussian进行对称破缺态的UHF计算,然后再使用orca的DLPNO-CCSD(T) 结合UHF关键词计算DLPNO-UCCSD(T)。然后顺手选了几个闭壳层分子想测试一下,才发现了上述现象。个人接下来可能放弃DLPNO计算,直接使用CCSD(T)结合小一点的基组计算该体系。感谢老师,学到了很多平时会忽略的地方。
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wzkchem5    时间: 2022-11-15 21:24
qiqi7 发表于 2022-11-15 13:55
感谢老师的解答。因为结构较多,我是想用DLPNO-CCSD(T)计算,然后计算单点能过程中,大多数分子能量合理 ...

其实可以尝试一下用orca的NEVPT2算一下,那个苯环的轨道可以不纳入活性空间,只把剩下8个碳原子的垂直于平面的p轨道纳入活性空间。这个计算可以用RI加速,虽然也可以用DLPNO,但这个大小的体系DLPNO-NEVPT2估计不比RI-NEVPT2快。有条件的话可以再加F12校正,来解决基组误差问题。
这个计算结果应该比UCCSD(T)靠谱,毕竟是多参考态方法,既size consistent又没有自旋污染。
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qiqi7    时间: 2022-11-16 09:32
wzkchem5 发表于 2022-11-15 21:24
其实可以尝试一下用orca的NEVPT2算一下,那个苯环的轨道可以不纳入活性空间,只把剩下8个碳原子的垂直于 ...

好的,感谢老师,我去尝试一下
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wjc404    时间: 2022-11-18 10:59
本帖最后由 wjc404 于 2023-2-16 18:43 编辑

同意二楼的看法,这个分子的对称破缺被HF高估了。
尝试了以下计算过程:
(1)用m06-2X/def2-TZVP优化几何结构,得到平面无扭曲的结构,无虚频,波函数稳定(无自旋极化)。接下来的步骤在该几何结构下进行,基组不变。
(2)用HF得到稳定的波函数,为自旋极化波函数,S2 = 1.03。用stable=opt关键词,或先设置两个片段(茚环和茂环各为一片段)生成片段组合波函数然后优化,结果一样。
(3)用Brückner-CCD优化上一步UHF所得的轨道,发现过程中参考波函数<S**2>逐渐降至0.01以下,最后的最大双激发幅度为0.053。
(4)上一步优化的轨道投影到spin-restricted模式,然后Brückner-CCD计算出密度矩阵,从自然轨道看,1以上的最低三个占据数为1.91/1.91/1.90,1以下的最高三个占据数为0.09/0.07/0.06。
以上结果应该能说明,这个分子在最优结构下的静态相关不强,HF无法合适描述它的可能原因是缺乏动态相关的考虑。HF的这一问题在大共轭体系中不罕见。
计算结果见https://pan.baidu.com/s/1S88wjWKVaF7fI-H7SJXVLw,提取码44ik。


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qiqi7    时间: 2022-11-20 10:18
wjc404 发表于 2022-11-18 10:59
同意二楼的看法,这个分子的对称破缺被HF高估了。
尝试了以下计算过程:
(1)用m06-2X/def2-TZVP优化几 ...

感谢大佬,给我以后遇到量化问题时自己分析问题提供了一些思路




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