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标题: 作电子密度差图得出结果有异 [打印本页]

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Author: 楠楠 时间: 2022-11-16 09:00
标题: 作电子密度差图得出结果有异
各位老师好想请教一下学生做电子密度差图，是含有两个溴的体系（未与主链相连），我用整体减去两个溴再减去剩余部分，得到如下图。溴的周围是蓝色我能理解电子密度降低了因为部分电子转移到了主链可是主链不应该是绿色吗？为啥主链也有蓝色还很多呢？

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Author: wudiazhu 时间: 2022-11-16 09:11
你的电荷没设对，整体应该带-2电荷

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Author: 楠楠 时间: 2022-11-16 09:42

wudiazhu 发表于 2022-11-16 09:11
你的电荷没设对，整体应该带-2电荷

我将整体的改为（-2,3）算了一下还是不对也是主链同时有蓝和绿色分布

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Author: 冰释之川 时间: 2022-11-16 10:08
本帖最后由冰释之川于 2022-11-16 10:09 编辑

楠楠发表于 2022-11-16 09:42
我将整体的改为（-2,3）算了一下还是不对也是主链同时有蓝和绿色分布

主链有电子密度增加与减少的区域交替出现不是很正常的么，就像一颗石头引起的涟漪，总有起伏传递开来的。。不放心的话，你对电子密度差函数在主链原子空间下进行积分，得到的值应该是正值

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Author: 楠楠 时间: 2022-11-16 10:11

冰释之川发表于 2022-11-16 10:08
主链有电子密度增加与减少的区域交替出现不是很正常的么，就像一颗石头引起的涟漪，总有起伏传递开来的。 ...

好的老师主要是我怕我这样证明溴电子转移到主链会被审稿人质疑。
老师能请教一下这个在主链原子空间下进行积分是可以通过multiwfn直接输出的吗？还是需要自己进行积分计算

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Author: 冰释之川 时间: 2022-11-16 10:13
本帖最后由冰释之川于 2022-11-16 10:17 编辑

楠楠发表于 2022-11-16 10:11
好的老师主要是我怕我这样证明溴电子转移到主链会被审稿人质疑。
老师能请教一下这个在主链原子空间 ...

Multiwfn手册里能完成，具体看模糊原子空间分析。
最终效果可以参考这种图(https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcc.9b08050)：
(, 下载次数 Times of downloads: 10)

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Author: 楠楠 时间: 2022-11-16 15:40

冰释之川发表于 2022-11-16 10:13
Multiwfn手册里能完成，具体看模糊原子空间分析。
最终效果可以参考这种图(https://pubs.acs.org/doi/10 ...

老师想请教一下是指这样做吗？

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Author: 冰释之川 时间: 2022-11-16 15:45

楠楠发表于 2022-11-16 15:40
老师想请教一下是指这样做吗？

是的，但是最后一步要选自定义函数，具体的看Multiwfn手册

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Author: 楠楠 时间: 2022-11-16 21:07

冰释之川发表于 2022-11-16 10:08
主链有电子密度增加与减少的区域交替出现不是很正常的么，就像一颗石头引起的涟漪，总有起伏传递开来的。 ...

老师好我按照您的指导分别对主链和两个溴进行了积分计算
得出的主链数值为1599 两个溴是281
请问老师二者输出的值分别约为16%和2.8% 如何说明电子转移到了主链上呢？或者说主链的电子密度增加了呢？

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