计算化学公社

标题: 请教高手，300个原子的异质结，150个原子被固定, vasp能完成结构优化吗？ [打印本页]

作者
Author: wmg166 时间: 2022-11-17 11:22
标题: 请教高手，300个原子的异质结，150个原子被固定, vasp能完成结构优化吗？
请教高手，300个原子的异质结，150个原子被固定, vasp能完成结构优化吗？能计算出态密度吗？哪位有构建异质结的脚本求分享，我的QQ是：1870891108 万分感谢。

作者
Author: 含光君 时间: 2022-11-17 15:08
安装Vaspkit，804功能。具体操作见刘博士Materials Studio建模视频。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-17 17:32
用CP2K做这种体系的优化快得多，一般计算条件下毫无压力

作者
Author: wmg166 时间: 2022-11-17 17:45
不会cp2K 咋不？学新东西慢

作者
Author: wmg166 时间: 2022-11-17 17:49

含光君发表于 2022-11-17 15:08
安装Vaspkit，804功能。具体操作见刘博士Materials Studio建模视频。

vaspkit 804，是不是要导入两个晶胞的POSCAR , 我导入之后，生成好多个异质结，我需要的是沿着二者的最密排晶面构建的异质结。 vaspkit 804 是按照最密排晶面构建的吗？

作者
Author: 含光君 时间: 2022-11-17 21:36

wmg166 发表于 2022-11-17 17:49
vaspkit 804，是不是要导入两个晶胞的POSCAR , 我导入之后，生成好多个异质结，我需要的是沿着二者 ...

你把切好最密排晶面再建晶胞放到Vaspkit 804不就OK了。

另外，我也不太会使CP2K，非常期待社长即将开设的CP2K培训班。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-18 02:12

wmg166 发表于 2022-11-17 17:45
不会cp2K 咋不？学新东西慢

病句

使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件
http://sobereva.com/587（http://bbs.keinsci.com/thread-21668-1-1.html）
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/586（http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html）

作者
Author: wmg166 时间: 2022-11-18 09:27

含光君发表于 2022-11-17 21:36
你把切好最密排晶面再建晶胞放到Vaspkit 804不就OK了。

另外，我也不太会使CP2K，非常期待社长即将开 ...

804
+-------------------------- Warm Tips --------------------------+
See An Example in vaspkit/examples/MoS2_BP_heterostructure.
Set MAX_ATOM_NUMBER, MIN_LATTICE_ANGLE and MAX_LATTICE_ANGLE
in the ~/.vaspkit file to Screen Undesirable Heterostructures.
+---------------------------------------------------------------+
Input the Mismatch Tolerance (e.g. 0.5 means < 0.5%)

------------>>
0.5
Input the Interlayer Space and Vacuum Thickness (e.g., 2.5 10):

------------>>
3 15
  -->> (01) Reading Structural Parameters from POSCAR1 File...
  -->> (02) Reading Structural Parameters from POSCAR2 File...
Error: No structures found and try to relax the restrictions.

作者
Author: wmg166 时间: 2022-11-18 09:30

wmg166 发表于 2022-11-18 09:27
804
+-------------------------- Warm Tips --------------------------+
See An Example in va ...

我在MS切面后导出不了slab的cif 文件, 我只有导出晶胞，保存为POSCAR1 POSCAR2 , 使用vaspkit 804 时出现上述提示。我没找到 vaspkit/examples/MoS2_BP_heterostructure. 求分享

作者
Author: 含光君 时间: 2022-11-18 12:01

wmg166 发表于 2022-11-18 09:30
我在MS切面后导出不了slab的cif 文件, 我只有导出晶胞，保存为POSCAR1 POSCAR2 , 使用vaspkit 804 时 ...

上面说得很明白先切好你要的晶面再加真空层建晶胞，再用vaspkit建异质结构。
你的报错是说在你设置的Mismatch Tolerance下找不到合适的结构，应该调大这一参数。
examples在vaspkit的安装目录里面，不知道装哪里了就which vaspkit。
我不知道你是没找到你的vaspkit目录还是目录下真的没有，我用的1.3.3版本vaspkit安装目录下有这个文件。

作者
Author: wmg166 时间: 2022-11-18 21:29

含光君发表于 2022-11-18 12:01
上面说得很明白先切好你要的晶面再加真空层建晶胞，再用vaspkit建异质结构。
你的报错是说 ...

vaspkit 建模，自己无法设定层数。也看不出是哪两个面结合在了一起。

作者
Author: 含光君 时间: 2022-11-18 22:56

wmg166 发表于 2022-11-18 21:29
vaspkit 建模，自己无法设定层数。也看不出是哪两个面结合在了一起。

我这里说的是拿MS建模，到vaspkit生成异质结。

作者
Author: wmg166 时间: 2022-11-19 15:55

含光君发表于 2022-11-18 22:56
我这里说的是拿MS建模，到vaspkit生成异质结。

还有别的异质结脚本吗？ vaspkit 构建异质结会不会有遗漏，有的我建造出来了，vaspkit 提示： no structure .....

作者
Author: djjj148 时间: 2022-11-19 17:28

wmg166 发表于 2022-11-19 15:55
还有别的异质结脚本吗？ vaspkit 构建异质结会不会有遗漏，有的我建造出来了，vaspkit 提示： no struc ...

https://mp.weixin.qq.com/s/O6Nwwb5p07CKwUTynYNJkw

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