计算化学公社

标题: gmx 分析dipole 使用的中心有关问题 [打印本页]

作者
Author: Yura 时间: 2022-11-20 12:25
标题: gmx 分析dipole 使用的中心有关问题

求问，gmx dipole使用的中心是电荷中心吗？
如果分别使用gmx traj 和gmx dipole 计算了某个frame下的原子坐标和分子偶极矩，两者之间可以直接使用吗？是否存在起始中心不一致的问题？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-20 13:50
应该是坐标原点
你可以实际试试对于单个离子体系，把离子平移到盒子中不同位置的计算结果，如果变化了，就更确定是坐标原点了

作者
Author: Yura 时间: 2022-11-21 10:17
好的！谢谢！

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