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标题: 求助：如何获得纤维素分子在GLYCAM06力场下的拓扑文件？ [打印本页]

作者
Author: huashang 时间: 2022-11-22 15:50
标题: 求助：如何获得纤维素分子在GLYCAM06力场下的拓扑文件？
本帖最后由 huashang 于 2022-11-22 15:44 编辑

最近在使用GROMACS模拟纤维素在离子液体中溶解，文献中提到纤维素需要使用GLYCAM06力场，我有以下两个问题：1.GLYCAM06力场文件该怎么下载？
2.如何产生纤维素分子在GLYCAM06力场下的拓扑文件？

希望各位老师可以为我解惑，感激不尽。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-23 00:28
可以用AmberTools产生GLYCAM的Amber形式的拓扑文件，然后用acpype或ParmED转成GROMACS格式的拓扑文件用GROMACS跑

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