计算化学公社

标题: Quantum Espresso 多核报错 [打印本页]

作者
Author: Shana 时间: 2022-11-22 09:05
标题: Quantum Espresso 多核报错
小弟最近在学习Quantum Espresso，通过网上的教程安装了Quantum Espresso后，成功的运行了测试案例。但是当我开始多原子体系的计算时，如果计算资源大于8核，就会报错；小于8核，成功运行。

报错如下：
小弟观察了一下，怀疑是内存在每个核心上分配不错造成的。但是我的服务器是128核，512G内存，原则上是完全足够的。
而且QE所调用的内存也是远低于机器内存的。
小弟不懂这方面的内容，想请教各位老师，这种情况应该怎么处理?

作者
Author: Shana 时间: 2022-11-22 09:05
@卡开发发，卡老师有时间的话，可以指点一下吗？

作者
Author: rabbitkiller 时间: 2022-11-22 14:54
mpirun -np 16 pw.x -ndiag 1 -inp ....

试试串行的diagonalization运行，用-ndiag 1参数。

作者
Author: Shana 时间: 2022-11-22 15:49

rabbitkiller 发表于 2022-11-22 14:54
mpirun -np 16 pw.x -ndiag 1 -inp ....

试试串行的diagonalization运行，用-ndiag 1参数。

好的，我试试，谢谢老哥。

作者
Author: hzliew 时间: 2022-11-28 15:19
解决了吗

作者
Author: lawloh 时间: 2022-12-22 17:03
我最近也碰到一样的问题，是因为没编译好吗

作者
Author: 丁越 时间: 2022-12-22 17:31

lawloh 发表于 2022-12-22 17:03
我最近也碰到一样的问题，是因为没编译好吗

当你的原子数很少，但同时调用的核数又挺多时会有这个问题，我也遇到过。原子数少就少点核数调用。

作者
Author: leeru 时间: 2022-12-22 18:12
-ndiag 1

作者
Author: lawloh 时间: 2022-12-22 19:21

丁越发表于 2022-12-22 17:31
当你的原子数很少，但同时调用的核数又挺多时会有这个问题，我也遇到过。原子数少就少点核数调用。

如果核数过多会报错，这个我理解。但是我用7.1核数比较高会计算自动退出，out文件没有报错，但是命令行显示MPI通讯错误，用7.0就没有问题。感觉还是编译出了问题

作者
Author: Shana 时间: 2022-12-26 16:20

hzliew 发表于 2022-11-28 15:19
解决了吗

解决了，楼上的方法

作者
Author: Shana 时间: 2022-12-26 16:21

lawloh 发表于 2022-12-22 17:03
我最近也碰到一样的问题，是因为没编译好吗

楼上的方法能解决

作者
Author: Quantum198907 时间: 2023-1-25 00:17
同样的问题，我用mpirun -np 16 pw.x -nk 4 -inp ....解决

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