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标题: 求助模拟两个离子的结构优化的问题 [打印本页]

作者
Author: han- 时间: 2022-11-23 09:27
标题: 求助模拟两个离子的结构优化的问题
各位老师，请问我现在要模拟优化两个离子，是必须要挖团簇、加入背景电荷和抗衡离子这些吗？只是想优化两个离子收敛，两个阴离子（处于固体熔融态）

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-11-23 15:28
对。本来有的情况下用隐式溶剂模型来近似就可以了，但是你这种情况下有以下问题：（1）如果不加抗衡离子，即使加溶剂模型，两个阴离子也会飞到无穷远；（2）如果加抗衡离子，必须对抗衡离子做显式溶剂化；（3）但是你的体系其实不是溶剂，而是离子固体，所以一旦对抗衡离子做显式溶剂化，就需要加更多的阴离子，这些阴离子又需要更多的抗衡离子，永远加不完。所以只能退而求其次，用背景电荷（最好是用embedding potential）代替实际的阴离子来描述抗衡离子的第一配位层，因为背景电荷本身不需要显式溶剂化，所以可以只加有限层而不会导致任何问题。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-24 02:40
这种情况用CP2K当周期性搞就完了，用簇模型很麻烦

作者
Author: han- 时间: 2022-11-24 10:35

sobereva 发表于 2022-11-24 02:40
这种情况用CP2K当周期性搞就完了，用簇模型很麻烦

老师，您的意思是这个离子反应的模拟可以直接用cp2k做吗？不需要背景电荷这些吗？
这个反应没有溶剂，之前没有接触过CP2K，刚刚看了几个帖子的例子都是分子、晶体的模拟，也看了您发的Multiwfn创建CP2K的输入文件，目前还没有看到离子的例子，纯离子的话要如何下手呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-25 01:49

han- 发表于 2022-11-24 10:35
老师，您的意思是这个离子反应的模拟可以直接用cp2k做吗？不需要背景电荷这些吗？
这个反应没有溶剂，之 ...

显然可以CP2K
加背景电荷是为了描述凝聚相环境下周围的原子的影响，CP2K计算时直接就对凝聚相体系当周期性计算了，自然没背景电荷的事
离子就离子，该怎么算怎么算，本身是离子的物质，电子结构自然会收敛到离子的状态

作者
Author: han- 时间: 2022-12-2 11:49

sobereva 发表于 2022-11-25 01:49
显然可以CP2K
加背景电荷是为了描述凝聚相环境下周围的原子的影响，CP2K计算时直接就对凝聚相体系当周期 ...

老师我安装了cp2k，我这个是模拟固体熔融状态时的阴离子反应，我在用cp2k模拟的时候，如何考虑阳离子的影响呢？（还是说不用考虑？）反应没有溶剂也就没有其他帖子说的盒子
我的目的是 想要得到这个状态下离子反应的自由能垒
（目前我根据您的帖子由multiwfn得到了.inp文件）

作者
Author: sobereva 时间: 2022-12-3 01:55

han- 发表于 2022-12-2 11:49
老师我安装了cp2k，我这个是模拟固体熔融状态时的阴离子反应，我在用cp2k模拟的时候，如何考虑阳离子的 ...

不需要做任何额外考虑

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