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标题: MS中能不能让原子只起到占位作用，而对其他原子没有影响 [打印本页]

作者
Author: dark_cosmos 时间: 2016-5-28 15:31
标题: MS中能不能让原子只起到占位作用，而对其他原子没有影响
我想实现一种模型：在一个CNT周围的空间全部都是不能进入的，所以想通过加一些只是起到“占位”作用的原子，但是不能对CNT内部有影响，而且不能对整体能量有影响。我试过使用pvff力场，将添加的原子的vDW相互作用给ignore，但是这样的话就相当于没有了占位作用，很是郁闷

，不知道大家有没有什么好办法。

作者
Author: sobereva 时间: 2016-5-28 17:56
MS的很多事已经记不清了，如果能把vdW里r-12项保留而只把r-6对应的参数设为0也可以起到占位作用。

作者
Author: dark_cosmos 时间: 2016-5-29 13:34

sobereva 发表于 2016-5-28 17:56
MS的很多事已经记不清了，如果能把vdW里r-12项保留而只把r-6对应的参数设为0也可以起到占位作用。

谢谢sob老师的回复！我试了一下，MS里面的vDW相互作用只有附件中的几个选项，没有办法分离。请问sob老师，像这种“占位型”的模型有没有什么好的办法。我试过加上dummy原子或者把vdW相互作用ignore，结果MS都认为这个地方没有原子，所以这个问题很是郁闷啊

作者
Author: sobereva 时间: 2016-5-29 18:32

dark_cosmos 发表于 2016-5-29 13:34
谢谢sob老师的回复！我试了一下，MS里面的vDW相互作用只有附件中的几个选项，没有办法分离。请问sob老师 ...

我很久不用forcite记不清那些参数是可调的。
如果不能把LJ势的吸引和互斥两部分分离，按照图中，可以试试repulsive exponential

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