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标题: 求助：使用sobtop指认原子类别报错 [打印本页]

作者
Author: ghkjhug 时间: 2022-11-24 23:37
标题: 求助：使用sobtop指认原子类别报错
本帖最后由 ghkjhug 于 2022-11-24 23:40 编辑

依照教程整理的几种适用于GROMACS输入的小分子拓扑文件获取流程_CocoCream的博客-CSDN博客_gromacs拓扑文件生成小分子拓扑文件时，于第三步第10行，即使用GAFF原子类型后出现如下错误： (, 下载次数 Times of downloads: 11)

进入文件修改后发现，当标记处数字改变，未识别原子的数据随之改变（如改为2，报错则为name （ 2）
(, 下载次数 Times of downloads: 15)
请问各位大大应如何更改以解决这一问题

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-25 20:33
用gview之类保存成相对标准的mol2文件再试

作者
Author: ghkjhug 时间: 2022-11-26 09:36

sobereva 发表于 2022-11-25 20:33
用gview之类保存成相对标准的mol2文件再试

感谢，使用gview成功了，之前用的openbabel

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