计算化学公社

标题: CPU并行，一个满载，一个偷懒 [打印本页]

作者
Author: lurensan 时间: 2022-11-27 19:42
标题: CPU并行，一个满载，一个偷懒
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各位大佬，两个CPU这样工作正常吗？是不是在并行？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-28 02:22
不知道你怎么运行的
对比一下18核和36核并行的速度，就能判断是否摊给两个CPU运行。光从温度和功耗来看目前比较异常

作者
Author: paramecium86 时间: 2022-11-28 08:43
不知道你运行的是什么程序。如果是win64位版的高斯那我也碰到过。我之前用2698v4也遇到过这个情况。可以试试关掉超线程再试试。总的逻辑处理器数目不超过64的话好像就没有这个问题。

作者
Author: lurensan 时间: 2022-11-28 10:31
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老师，这是18核的并行情况。同样使用的是虚拟机centos7.6的gaussian 16。好像就是不太正常，需要怎么调整呢？

作者
Author: lurensan 时间: 2022-11-28 10:33
本帖最后由 lurensan 于 2022-11-28 10:49 编辑

paramecium86 发表于 2022-11-28 08:43
不知道你运行的是什么程序。如果是win64位版的高斯那我也碰到过。我之前用2698v4也遇到过这个情况。可以试 ...

我用的是centos的g16，我试试关了超线程，两个CPU都工作了
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Author: 3969832 时间: 2022-11-28 10:53
win有问题重装换centos就好了 centos开超线程也能正常双CPU满载

作者
Author: paramecium86 时间: 2022-11-28 13:08

lurensan 发表于 2022-11-28 10:33
我用的是centos的g16，我试试关了超线程，两个CPU都工作了

嗯那就跟我遇见的情形类似。不知道为啥超过64个逻辑核心就会有问题。

作者
Author: anson 时间: 2023-1-4 23:22
楼主有没有对比过关HT的2U工作和开HT的1U偷懒1U满载的计算时间呢

作者
Author: lurensan 时间: 2023-1-5 11:06

anson 发表于 2023-1-4 23:22
楼主有没有对比过关HT的2U工作和开HT的1U偷懒1U满载的计算时间呢

这倒没有，把HT关了就再也没管过了

作者
Author: anson 时间: 2023-1-5 15:36

lurensan 发表于 2023-1-5 11:06
这倒没有，把HT关了就再也没管过了

刚刚试了一下，机器是2×2699v3

用ORCA算异丙醇的ZPE，开HT平均57s左右（1U满载，1U睡觉，频率2.7左右），关HT平均45s（2U都是100%满载，频率干到了3.1），但是我感觉这么小的体系可能实际参考意义不大。
现在扔了个以前开HT的要2.5d的进G16里，看看关了HT得要多久

作者
Author: lurensan 时间: 2023-1-5 18:10

anson 发表于 2023-1-5 15:36
刚刚试了一下，机器是2×2699v3
用ORCA算异丙醇的ZPE，开HT平均57s左右（1U满载，1U睡觉，频率2.7 ...

👍👍看看偷懒能偷懒到啥水平。

作者
Author: anson 时间: 2023-1-6 00:56

lurensan 发表于 2023-1-5 18:10
👍👍看看偷懒能偷懒到啥水平。

目前看到开HT时节点0基本全部占用都在90%以上，节点1只有一两个线程50%左右（可能是其他程序占用的）剩下的都是10%以下，整体CPU占用率在56%左右；关了HT看到两个节点占用都是90%以上，整体占用顶着100%。
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作者
Author: lurensan 时间: 2023-1-6 10:15

anson 发表于 2023-1-6 00:56
目前看到开HT时节点0基本全部占用都在90%以上，节点1只有一两个线程50%左右（可能是其他程序占用的）剩下 ...

计算时间上呢，感觉大点的体系时间差距也会不小，毕竟有个躺平的cpu在拖后腿

作者
Author: anson 时间: 2023-1-6 14:49

lurensan 发表于 2023-1-6 10:15
计算时间上呢，感觉大点的体系时间差距也会不小，毕竟有个躺平的cpu在拖后腿

刚刚算完，感觉挺离谱的。算的是57个原子体系的单点能，关键词wB97XD def2TZVPP scrf=smd。
开HT是2d4h46min，关HT是11h40min。

作者
Author: lurensan 时间: 2023-1-6 19:48

anson 发表于 2023-1-6 14:49
刚刚算完，感觉挺离谱的。算的是57个原子体系的单点能，关键词wB97XD def2TZVPP scrf=smd。
开HT是2d4h4 ...

这cpu躺平的不是一点点啊。

还是关了超线程吧

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Author: anson 时间: 2023-1-6 21:35

lurensan 发表于 2023-1-6 19:48
这cpu躺平的不是一点点啊。还是关了超线程吧

准备趁春节放假我再多做几个测试对比看看

单从现在的数据看跟sob老师文章（http://sobereva.com/392）中的描述不太相符啊

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