计算化学公社

标题: 求助关于偶极子角度分布的结果分析 [打印本页]

作者
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小雷森    时间: 2022-11-27 22:34
标题: 求助关于偶极子角度分布的结果分析
如图,求助社长,在模仿论文里计算材料表面的亲疏水性,看到文献(Chin. Phys. B Vol. 30, No. 1 (2021) 010503)里有关于偶极子角度分布的图,想试着做一下。我用gmx dipoles做了分析,但是不知道用哪个结果画图,来请教一下会长。


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作者
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sobereva    时间: 2022-11-28 02:18
gmx dipoles应该干不了这个
自己写个VMD脚本分析就完了
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小雷森    时间: 2022-11-28 10:46
sobereva 发表于 2022-11-28 02:18
gmx dipoles应该干不了这个
自己写个VMD脚本分析就完了

会长,那分析的思路是什么啊?
作者
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sobereva    时间: 2022-11-28 10:47
小雷森 发表于 2022-11-28 10:46
会长,那分析的思路是什么啊?

循环每个水分子,计算O与H...H中点连线方向的矢量,求与界面的夹角。对各帧、各个水都这么算,求各种角度的出现概率
作者
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小雷森    时间: 2022-11-28 10:59
sobereva 发表于 2022-11-28 10:47
循环每个水分子,计算O与H...H中点连线方向的矢量,求与界面的夹角。对各帧、各个水都这么算,求各种角度 ...

好的,社长。我去试试




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