计算化学公社

标题: 用opt=modredundant做柔性扫描出现错误 [打印本页]

作者
Author:
一昔a    时间: 2022-11-27 19:15
标题: 用opt=modredundant做柔性扫描出现错误
在用以下输入文件练习柔性扫描时,一开始Gaussian没有报错,但我晚上回来的时候程序已经自动终止了,新手看out文件没看不太懂,没发现问题在哪里。输入文件如下所示:%chk=C:\Users\admin\Desktop\gausssian-practise\TPENN.chk


#p b3lyp 6-31+g* em=gd3bj  opt=modredundant

ground state(limit)

0 1
C                 23.71979074   -1.26382817   -3.08250951
C                 23.76366075   -2.59711612   -2.96574017
C                 22.72112946   -3.25911599   -2.44081997
C                 21.59750489   -2.63691370   -2.02218795
C                 21.58331178   -1.29400629   -2.16225080
C                 22.61917770   -0.61474172   -2.68011865
C                 20.57503847   -3.33646192   -1.46043885
C                 19.34209987   -2.79600838   -1.26592524
C                 20.80218364   -4.61605286   -1.04833652
C                 19.74122078   -5.45735594   -0.91741630
C                 22.07830744   -5.00952890   -0.78484876
C                 22.45076028   -6.30641217   -0.73085627
C                 23.71553968   -6.68803071   -0.49306541
C                 24.67005762   -5.76975218   -0.29488779
C                 24.33711359   -4.47335825   -0.34265659
C                 23.06768531   -4.11049309   -0.58559229
C                 19.72727970   -6.49168614   -0.04935539
C                 18.67523104   -7.31633802    0.07303257
C                 17.58170963   -7.12845526   -0.67698864
C                 17.55699701   -6.10199250   -1.53676221
C                 18.61569711   -5.28395644   -1.64474589
C                 18.45550831   -3.35762091   -0.41680853
C                 17.23984568   -2.83534820   -0.19547577
C                 16.82061404   -1.72467128   -0.82388041
C                 17.68922943   -1.16637449   -1.68353329
C                 18.90855113   -1.68594687   -1.89806275
O                 15.58256790   -1.19182357   -0.58927383
C                 15.21265098   -0.15884635   -1.42081853
C                 14.09631708    0.59957230   -1.18684511
O                 15.90143072    0.04010525   -2.40534318
C                 13.30743018    0.35912335   -0.12038980
C                 12.19491265    1.07686080    0.13861392
C                 11.87924059    2.07579184   -0.70751237
C                 12.64903511    2.33416837   -1.77432891
C                 13.74601899    1.60173859   -2.01549881
N                 11.52576793    0.74602339    1.16530513
N                 10.48379897    1.37696973    1.45386853
C                  9.79711797    1.02770817    2.46116697
C                  8.69255633    1.74527222    2.72823588
C                  7.89469049    1.45279672    3.76745706
C                  8.13546732    0.42764395    4.61251471
C                  9.25248740   -0.27689076    4.32980664
C                 10.06044320    0.00610614    3.29431806
N                  7.36637469    0.14844971    5.60015861
C                  7.69862853   -0.99477481    6.49013231
C                  6.15274667    0.97158392    5.84522392
H                 24.57556601   -0.71071145   -3.50328223
H                 24.65756878   -3.14724551   -3.30495340
H                 22.81771541   -4.35567012   -2.39615742
H                 20.74374554   -0.68244228   -1.79254863
H                 22.57807340    0.48507470   -2.75609100
H                 21.73871549   -7.12108256   -0.93801406
H                 23.97745432   -7.75968994   -0.47828986
H                 25.71143850   -6.07529044   -0.10128700
H                 25.11057114   -3.70493924   -0.17384070
H                 22.86961166   -3.02547865   -0.57508131
H                 20.56502133   -6.67437895    0.64418522
H                 18.69954652   -8.14144634    0.80494249
H                 16.71356991   -7.80117988   -0.58189296
H                 16.66402486   -5.94120511   -2.16265844
H                 18.53434912   -4.48382806   -2.39954811
H                 18.71026574   -4.25000000    0.17943757
H                 16.56603430   -3.32377234    0.52927929
H                 17.38144962   -0.25834825   -2.22930534
H                 19.52727964   -1.18132494   -2.65864711
H                 13.55586730   -0.45666245    0.58003368
H                 10.99022444    2.71166085   -0.56293143
H                 12.37861031    3.15719328   -2.45800575
H                 14.33532326    1.86576942   -2.90899824
H                  8.42431175    2.60077917    2.08219094
H                  7.02133667    2.11462777    3.87875630
H                  9.57000344   -1.13757783    4.93966430
H                 10.94817093   -0.63360170    3.15241047
H                  8.67330686   -0.84402562    7.00597404
H                  6.94501511   -1.09591016    7.30186953
H                  7.67997867   -1.96058953    5.93581776
H                  5.43259686    0.89445933    4.99904768
H                  5.60520847    0.61057196    6.74361772
H                  6.41252830    2.03312412    6.05945854

32 36 37 38 F

24 27 28 30 S 5 20.


在输入文件中有以下字样,请问这是代表只读取了冻结原子的设置,我的二面角扫描没有被读取到吗,完整文件附在附件里面了

The following ModRedundant input section has been read:
D      32      36      37      38 F   



作者
Author:
zjxitcc    时间: 2022-11-27 19:27
两行坐标限制间 不要有空行
作者
Author:
一昔a    时间: 2022-11-27 19:35
zjxitcc 发表于 2022-11-27 19:27
两行坐标限制间 不要有空行

原来如此,谢谢指导,我还以为一开始能跑的动就代表输入文件没有问题呢。
作者
Author:
sobereva    时间: 2022-11-28 02:00
空行意味着一个字段的结束,显然不能乱空行,否则读入32 36 37 38 F后下面的扫描设置就不读了
作者
Author:
一昔a    时间: 2022-11-29 11:49
sobereva 发表于 2022-11-28 02:00
空行意味着一个字段的结束,显然不能乱空行,否则读入32 36 37 38 F后下面的扫描设置就不读了

嗯嗯了解了,谢谢老师,之后要去北京读博了,期待能去参加您的培训课程




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3