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标题: 求助ORCA几何优化有机分子一直不收敛 [打印本页]

作者
Author: fwan1006 时间: 2022-11-29 12:41
标题: 求助ORCA几何优化有机分子一直不收敛
各位老师，我最近刚开始用ORCA，不是很熟悉，算的时候几何优化一直不收敛，请帮忙看一看是输入文件设置上的原因吗？或者我该怎么设置？
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或者有其它我需要提供的比较重要的信息吗？
这是我的分子结构
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chemdraw画的之后用chem3D MM2优化了之后的结构

作者
Author: 牧生 时间: 2022-11-29 13:17
本帖最后由牧生于 2022-11-29 13:27 编辑

把这个羟基往箭头方向挪过去一点会比较好 (, 下载次数 Times of downloads: 19)

你这个优化的级别需要商酌一下，好歹用b97-3c

见
http://bbs.keinsci.com/thread-13560-1-1.html

作者
Author: fwan1006 时间: 2022-11-29 13:55

牧生发表于 2022-11-29 13:17
把这个羟基往箭头方向挪过去一点会比较好

你这个优化的级别需要商酌一下，好歹用b97-3c

- -, 我这个orca的版本太旧了，还是3.0.1的，竟然识别不了B97-3C

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-11-29 15:11
此外这个分子不稳定，有脱SO2、然后生成HSO3-，用硫原子向醌羰基亲核加成的倾向。如果实验表征数据不完备的话，建议重新考虑一下结构是不是你画的样子

作者
Author: fwan1006 时间: 2022-11-29 15:49

wzkchem5 发表于 2022-11-29 15:11
此外这个分子不稳定，有脱SO2、然后生成HSO3-，用硫原子向醌羰基亲核加成的倾向。如果实验表征数据不完备的 ...

是，这个分子是虚构的。它结构不稳定是不是也是导致几何优化不出来的原因之一？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-11-29 16:21

fwan1006 发表于 2022-11-29 08:49
是，这个分子是虚构的。它结构不稳定是不是也是导致几何优化不出来的原因之一？

不稳定的分子一般优化会倾向于困难一些，但是两者的关系也不是特别大。
我又看了一下你的理论级别，这个级别即使收敛了结果也是不能用的，必须改用DFT方法（包括但不限于B3LYP、M062X），如果使用B3LYP等不能描述色散的泛函的话，还要加色散校正。

作者
Author: zjxitcc 时间: 2022-11-29 16:55

fwan1006 发表于 2022-11-29 13:55
- -, 我这个orca的版本太旧了，还是3.0.1的，竟然识别不了B97-3C

强烈不建议继续算下去，当务之急是立即下载ORCA 5.0.3

作者
Author: exity 时间: 2022-11-29 18:40
这方法基组搭配也挺有意思的。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-30 09:40
绝对不要自己手写【新手求助】这种标签，http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给你去了，以后注意

拿HF优化毫无意义，文章根本发不出去。提问时候不要光贴个二维结构，谁也不知道你用的初猜结构到底长什么样，二维结构又体现不出来实际立体结构。
倘若这分子能稳定存在，能量较低构象肯定会出现分子内氢键。摆初猜结构时把这点考虑进去

作者
Author: fwan1006 时间: 2022-12-1 17:47

sobereva 发表于 2022-11-30 09:40
绝对不要自己手写【新手求助】这种标签，http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给 ...

sob老师，我按论坛里的装了openmpi和orca5.0.3，然后算的时候老是出现这个问题，您能帮忙解读一下吗？
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作者
Author: sobereva 时间: 2022-12-2 02:43

fwan1006 发表于 2022-12-1 17:47
sob老师，我按论坛里的装了openmpi和orca5.0.3，然后算的时候老是出现这个问题，您能帮忙解读一下吗？

...

没细节没法说，起码上传输入输出文件

如果怀疑是并行的问题，先尝试串行能否运行

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