热力学循环如图所示:结构优化各物质级别一样6-311+g**,对Fe3+用SDD赝势;能量计算时对带负电的配体EDTA4-和络合物Fe3+(EDTA4-)用了def2-TZVPD基组,其余带正电的物质用def2-TZVP基组;请问这样合理吗,还是说因为需要保持一致性所有物质都用def2-TZVPD基组(或者我为了节省时间都不加弥散)。此文献中能量计算用的是Jaguar和Turbomole程序,对不同的金属离子使用全电子基组TZVP或LACV3P基组
文献:[1]Garima, Chauhan, Matthias, et al. The thermodynamics and biodegradability of chelating agents upon metal extraction[J]. Chemical Engineering Science, 2015. 作者Author: wzkchem5 时间: 2022-11-30 02:18
举个例子:EDTA的氧原子在EDTA4-里带负电,所以所有物种里面EDTA的氧原子都需要加弥散,包括和Fe3+络合以后,甚至包括被质子化以后,都需要加弥散。但是EDTA里的其他原子(C、H、N)不用加弥散,其他在整篇文章里都不会带较多负电的氧原子(例如水分子、配位水)也可以不加。
但是假如你结构优化已经按6-311+G**做完了,不想去掉弥散重做的话,会面临一个问题,万一审稿人问”为什么结构优化对C、N加了弥散,单点能反而不加“,不好回答。此时建议给C、N以及其他的O也加上弥散。(当然给结构优化去掉多余的弥散函数重新做也是一个选择)
此外,def2-TZVPD的弥散函数是为极化率等计算而设计的,对于负离子体系的单点能,用ma-def2-TZVP(又称ma-TZVP)性价比高一些作者Author: 小七丫 时间: 2022-12-7 09:36
明白了,我结构优化已经做完了,得用ma对C.N.O加弥散