计算化学公社

标题: 求助CP2K计算同一分子不同晶态的能量的两个问题 [打印本页]

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1739140886    时间: 2022-11-30 10:32
标题: 求助CP2K计算同一分子不同晶态的能量的两个问题
各位老师好,有一个140原子数的有机分子(只有C、H、O),它有三种晶态a、b、c(均有单晶结构),其中a相最稳定。1.现在想要通过能量的角度证明a相能量最低,可否使用CP2K分别计算单个晶胞的总能量来进行对比呢?
2.每相的单胞中都不是完整分子,计算时需要考虑超胞嘛?
谢谢老师回答!

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sobereva    时间: 2022-11-30 10:44
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “CP2K计算同一分子不同晶态的能量” 改了,以后务必注意

1 可以

2 不需要。搞清楚什么叫周期边界条件。
由于当前原胞不够大,计算时记得考虑k点.

作者
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1739140886    时间: 2022-11-30 15:26
sobereva 发表于 2022-11-30 10:44
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

感谢sob老师,以后标题会注意。
还想请教您,对于该体系的晶胞(250原子左右),用b3lyp-D3 + 6-311G**做结构优化(优化H原子),之后再用def2-TZVP算能量可行吗?
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sobereva    时间: 2022-12-1 04:04
1739140886 发表于 2022-11-30 15:26
感谢sob老师,以后标题会注意。
还想请教您,对于该体系的晶胞(250原子左右),用b3lyp-D3 + 6-311G** ...

如果考虑k点,CP2K此时没法用杂化泛函
PBE-D3(BJ)/DZVP-MOLOPT-SR-GTH考虑k点做优化就完了
CP2K里适合用的基组和量化程序有天壤之别。算能量用TZVP-MOLOPT-GTH
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1739140886    时间: 2022-12-1 09:59
sobereva 发表于 2022-12-1 04:04
如果考虑k点,CP2K此时没法用杂化泛函
PBE-D3(BJ)/DZVP-MOLOPT-SR-GTH考虑k点做优化就完了
CP2K里适合 ...

好的,感谢sob老师回复!学到了!
作者
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1739140886    时间: 2022-12-1 14:46
sobereva 发表于 2022-12-1 04:04
如果考虑k点,CP2K此时没法用杂化泛函
PBE-D3(BJ)/DZVP-MOLOPT-SR-GTH考虑k点做优化就完了
CP2K里适合 ...

sob老师,还有一个关于k点的问题想请教您。
我第一次进行有关周期性体系的计算,a、b、c三个晶胞的尺寸和空间群都不一样,那么k点设置可以相同吗(比如5,5,5)?
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sobereva    时间: 2022-12-2 02:29
1739140886 发表于 2022-12-1 14:46
sob老师,还有一个关于k点的问题想请教您。
我第一次进行有关周期性体系的计算,a、b、c三个晶胞的尺寸 ...

这种情况都应当用足够大、大到足矣令各自能量随k点增加达到收敛的k点数。可以对每个体系都做个k点收敛性测试
作者
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1739140886    时间: 2022-12-2 11:49
sobereva 发表于 2022-12-2 02:29
这种情况都应当用足够大、大到足矣令各自能量随k点增加达到收敛的k点数。可以对每个体系都做个k点收敛性 ...

好的,感谢sob老师!




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