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标题: ms如何使用自定义立场以及模拟成键断键 [打印本页]

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Author: 咔哧咔哧脆 时间: 2022-12-1 13:36
标题: ms如何使用自定义立场以及模拟成键断键
本帖最后由咔哧咔哧脆于 2022-12-1 13:45 编辑

我最近在学习分子成核模拟，想请教一些问题。原文献如下所示：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.5b03801
Molecular Dynamics Simulation Study of the Early Stages of Nucleation of Iron Oxyhydroxide Nanoparticles in Aqueous Solutions | The Journal of Physical Chemistry B (acs.org)
原文献使用软件为DL_Poly
我暂时先使用AC模块建立盒子，然后使用的Forcite模块的dynamics进行动力学模拟，在这当中我发现我无法复现原文献中的键的形成与断裂（如下所示）。
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所以我现在有以下问题：
1. 我想复现原文献中以下力场，该势函数暂时没有找到对应的形式，应如何添加？
(, 下载次数 Times of downloads: 2)

2. 我所使用的模块能否完成图一所示的涉及到键的形成与断裂的模拟过程，如果不能，应该使用哪些模块？

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