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标题: 集群AMD EPYC 7H12和Intel Xeon Scalable Gold 6330 选那个 [打印本页]

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心有秦天    时间: 2022-12-1 15:42
标题: 集群AMD EPYC 7H12和Intel Xeon Scalable Gold 6330 选那个
本帖最后由 心有秦天 于 2022-12-2 10:22 编辑

课题组准备购买服务器建一个集群,主要用来跑vasp和lammps,预算100万以内。服务器厂家给了两套方案,希望大家给点建议,不知道Intel Xeon Scalable Gold 6330 和AMD EPYC 7H12那个比较好,谢谢啦!!!

   方案一:
管理节点(1套,机架式):2颗AMD EPYC 7282 正式版CPU, Infinity架构,16 Core,32 Thread,2.8 GHz, Turbo 3.2 GHz,64 MB三级缓存;128GB DDR4 RECC Shared Memory,速度快、安全性高、稳定性好,适用于中高端服务器及图形工作站;1TB M.2 NVMe固态硬盘作系统加速盘;6块8TB 7200RPM SATA 企业级硬盘组建RAID5存储数据;FDR 56Gbps InfiniBand                                    
计算节点(8套,机架式):2颗AMD EPYC 7H12 正式版CPU, Infinity架构,单颗64 Core,128 Thread,2.6 GHz, Turbo 3.3 GHz,256 MB三级缓存;256GB DDR4 RECC Shared Memory,速度快、安全性高、稳定性好,适用于中高端服务器及图形工作站;1TB M.2 NVMe固态硬盘作系统加速盘;
方案二:
1. 管理节点  (1台)
CPU:2颗Intel Xeon Scalable Silver 4314 正式版CPU,Ice Lake架构,单颗16 Core,32 Thread,2.4 GHz,Turbo 3.4 GHz,24 MB L3 Intel Smart Cache
内存:128GB DDR4 RECC Shared Memory,速度快、安全性高、稳定性好,适用于中高端服务器及图形工作站
硬盘:2TB M.2 NVMe固态硬盘作系统加速盘
其他:通讯端口基于PCI-E总线,满足并行计算低延迟的要求。
2. 存储节点 (1台)
CPU:2颗Intel Xeon Scalable Silver 4314 正式版CPU,Ice Lake架构,单颗16 Core,32 Thread,2.4 GHz,Turbo 3.4 GHz,24 MB L3 Intel Smart Cache
内存:128GB DDR4 RECC Shared Memory,速度快、安全性高、稳定性好,适用于中高端服务器及图形工作站
硬盘:2TB M.2 NVMe固态硬盘作系统加速盘;21块8TB 7200RPM SATA 企业级硬盘组建RAID5存储数据(其中18块8TB 7200RPM SATA 企业级硬盘组建RAID5,3块8TB 7200RPM SATA 企业级硬盘作热备盘)
RAID卡:支持RAID 0、1、5、10、50等,1GB高速缓存,理论接口传输速率最高可达12Gb/s
网络:FDR 56Gbps InfiniBand,QSFP+接口
其他:通讯端口基于PCI-E总线,满足并行计算低延迟的要求。支持多种扩展接口,方便后续升级。
3.计算节点 (9台)
CPU:2颗Intel Xeon Scalable Gold 6330 正式版CPU ,Ice Lake架构,单颗28 Core,56 Thread,2.0 GHz, Turbo 3.1 GHz,42 MB L3 Intel Smart Cache
内存:256GB DDR4 RECC Shared Memory,速度快、安全性高、稳定性好,适用于中高端服务器及图形工作站
硬盘:2TB M.2 NVMe固态硬盘作系统加速盘
网络:FDR 56Gbps InfiniBand,QSFP+接口
其他:通讯端口基于PCI-E总线,满足并行计算低延迟的要求。支持多种扩展接口,方便后续升级。



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abin    时间: 2022-12-1 18:18
本帖最后由 abin 于 2022-12-1 18:58 编辑

先说,你要不要多节点并行?

我同事,近期采购的8369B双路➕512GB内存,
设计为单节点多核心并行。
系统240GB+2TB NVMe固态。

千兆网络。

管理存储为8156双路➕64GB内存,
240G系统,
1TB固态放软件,
三个16TB机械裸盘,做数据以及备份。

因为主要用VASP,硬盘容量肯定够用的。

以上,一个管理和四个计算节点,开箱即用集群,
大概20万。


不过你的预算100万,应该是招标。

很多高性价比的机器,未必能买到。

如果采购规则限定供货商资质的话,
你能买到的东西,没有任何性价比可言。



另外,处理器选啥都行。或者,听用户的。

比如我的采购场景,
多数同事不置可否,
但是有两位同事表示,必须Intel处理器。
补充一下.
现在使用56Gbps IB, 不是说规格问题.
而是这玩意这么多年了, 能是新品吗?


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sobereva    时间: 2022-12-2 02:55
发帖时候不要用巨大字号,别人看着很难受
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心有秦天    时间: 2022-12-2 10:23
sobereva 发表于 2022-12-2 02:55
发帖时候不要用巨大字号,别人看着很难受

谢谢您的提示,已经修改字体大小!
作者
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RFBI    时间: 2022-12-2 10:29
这种采购。。。,昨天看了本校的竞价网成交的服务器单子,性能差到爆,价格贵上天
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心有秦天    时间: 2022-12-2 10:30
abin 发表于 2022-12-1 18:18
先说,你要不要多节点并行?

我同事,近期采购的8369B双路➕512GB内存,

非常感谢您的建议!!!偶尔需要多节点并行计算,不常用!
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刘恪立    时间: 2022-12-2 12:03
管理集群1设备整体费用加起来,设备费用也就值60万内吧,剩下的40万元基本上都是招标的费用,是自采还是招标?管理集群2基本上也是这个费用吧。。
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abin    时间: 2022-12-2 13:14
心有秦天 发表于 2022-12-2 10:30
非常感谢您的建议!!!偶尔需要多节点并行计算,不常用!

所以问题在于:
如果就算偶尔使用, 也许硬件条件具备.
一旦有多节点并行计算的需求, 那么从一开始, 就需要准备好硬件的.

如果有IB网络, 就是是56Gbps的, VASP还好了, 基本不需要硬盘I/O.
如果有疯狂读写的程序,
那么还需要考虑磁盘I/O性能.

56Gbps IB峰值读写性能可达7GB/s.
你的存储, 就算做不到7GB/s, 至少随机I/O也不能太差呀.

否则, 可能网络很卡, 一旦出现好几个需要磁盘I/O的程序, 机器就会特别慢的.

至于RAID5, 什么高达12Gb, 你算算是多少? 6Gb 大概稳定在600MB/s, 12Gb能稳定在1GB/s就不错了.

各个高校都有自主备案采购. 不用招标的.
不过似乎有限额的.
作者
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beowulf    时间: 2022-12-3 09:23
7h12千年的方案了吧,太老了。
侧重vasp选第二个。然后让厂商再给你三个计算节点。
lammps不知道偏向哪个处理器,无建议。
作者
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biogon    时间: 2022-12-3 18:08
abin 发表于 2022-12-1 18:18
先说,你要不要多节点并行?

我同事,近期采购的8369B双路➕512GB内存,

56g的设备早在16年左右就停产,现在都开始卖400g了
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abin    时间: 2022-12-3 20:58
本帖最后由 abin 于 2022-12-3 21:00 编辑
biogon 发表于 2022-12-3 18:08
56g的设备早在16年左右就停产,现在都开始卖400g了

哈哈哈……
你评估一下,楼主预算100万,
他会拿出来20万左右投资网络吗?

别说400G了,就是早几年的100G的,
一个交换机,起步八万。
一个卡➕线缆,保守估计6500元。

如果十台机器,网络就是8+6.5,接近15万了。

用这么好的网络,
得配合不错的并行文件系统吧?
存储加上Meta data server,怎么着,
仅并行文件系统,
就需要两三台机器呢……
说了这么多,还都是裸体硬件……

还需要把这一堆东西弄成能用的计算服务器呢……

好用的的网络,很贵的……
不晓得追求多节点并行的伙伴,
有没有钱升级网络和存储……

另,现在用56G,基本是翻新或者拆机货……
反正追求性价比吗,能凑合用就行……
是否稳定,问菩萨吧……

作者
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biogon    时间: 2022-12-4 16:47
abin 发表于 2022-12-3 20:58
哈哈哈……
你评估一下,楼主预算100万,
他会拿出来20万左右投资网络吗?

100g现在拆机卡都几百块了,交换机也没全新的了,库存两三万吧
作者
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abin    时间: 2022-12-4 16:59
biogon 发表于 2022-12-4 16:47
100g现在拆机卡都几百块了,交换机也没全新的了,库存两三万吧

你问问楼主,
拆机旧货他们要不要吧……

真正用这些东西的人都晓得,
如果硬件稳定,
新的旧的没什么区别的。

只是在招标现场,
评标专家问,100G的卡,多少钱,
如果说,用几百元的拆机货,
肯定是无法中标的。

自己拼装攒机,和招标采购是不同的事情了……

攒机,是最高性价比,旧货都行,
只要对得起价格,能用就行。

招标,要的是稳定可靠,
性价比,一般不考虑。
以上,仅仅代表我的个人言论。

反正又不是自己掏钱,机器稳定可靠才是第一位。

期望,看这个帖文的网友,
没买到称心如意的机器。

作者
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biogon    时间: 2022-12-4 20:08
abin 发表于 2022-12-4 16:59
你问问楼主,
拆机旧货他们要不要吧……

都要了56g的那些古董玩意,除了拆机二手还能有啥,只是不知道罢了,甚至CPU还有内存都有可能是拆机来的,这些东西招标的时候当然是不可能明说的了,甚至还有招标的把56g的东西当新品卖的





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