计算化学公社

标题: gaussian报错The name of the center is too long解决办法 [打印本页]

作者
Author:
jeamore    时间: 2022-12-3 19:23
标题: gaussian报错The name of the center is too long解决办法
遇到一个罕见的报错,在网上没有找到解决办法,现在已经解决了,在此记录一下供遇到相同问题的社友参考,报错内容如下:
Symbolic Z-matrix:
Charge = -2 Multiplicity = 1
N743                  3.94832   9.19387   17.08436
C744                  3.6378    8.17034   16.06667
C745                  4.42789   8.35071   14.762
O746                  4.8508    7.35884   14.17845
C747                  2.13573   8.00188   15.70941
C748                  1.15356   7.54113   16.78625
O749                  1.55075   7.24861   17.93442
O750                 -0.05326   7.47445   16.46554
The name of the center is too long.
N1050 -0.196977  5.834310  2.484449                                             
?
Error termination via Lnk1e in /home/gaussian/g16/l101.exe at Sat Dec  3 18:40:45 2022.

这个结构是从蛋白上挖出来的,提交gaussian运算的时候总是报The name of the center is too long的错误,后面测试发现是原子序号太大了,原子名称超过4位gaussian就无法处理,把输入文件里的原子序号去掉再提交就正常了

   -2    1
N743 3.948321  9.193873  17.084360
C744 3.637799  8.170339  16.066674
C745 4.427888  8.350714  14.761997
O746 4.850799  7.358837  14.178455
C747 2.135726  8.001875  15.709415
C748 1.153558  7.541134  16.786250
O749 1.550747  7.248606  17.934421
O750 -0.053256  7.474452  16.465544
N1050 -0.196977  5.834310  2.484449
C1051 -1.537018  6.334716  2.178737
C1052 -2.155946  7.360825  3.152555
O1053 -3.040068  8.106382  2.724450
C1054 -2.490314  5.124181  1.996236
……
改为
   -2    1
N 3.948321  9.193873  17.084360
C 3.637799  8.170339  16.066674
C 4.427888  8.350714  14.761997
O 4.850799  7.358837  14.178455
C 2.135726  8.001875  15.709415
C 1.153558  7.541134  16.786250
O 1.550747  7.248606  17.934421
O -0.053256  7.474452  16.465544
N -0.196977  5.834310  2.484449
C -1.537018  6.334716  2.178737
C -2.155946  7.360825  3.152555
O -3.040068  8.106382  2.724450
C -2.490314  5.124181  1.996236
……


作者
Author:
sobereva    时间: 2022-12-4 01:26
本来诸如C1054就是非法命名
要么写元素名,要么写元素序号。乱写的话,就算程序计算没报错,也说不定根本就不是算出来你实际想算的东西




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3