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标题: 分子动力学模拟中有没有体系有序度的描述符或者物理量? [打印本页]

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wangyueda    时间: 2022-12-5 19:59
标题: 分子动力学模拟中有没有体系有序度的描述符或者物理量?
请问下各位老师,在分子动力学模拟中,有没有相关的描述符或者物理量可以表征体系的有序度,比如常温下的水有序度要比低温下的水有序度要低(结冰有序度升高),体系总偶极矩的平方<M>2可以吗?

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牧生    时间: 2022-12-5 21:27
我只晓得f3和f4序参数,挺方便
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wangyueda    时间: 2022-12-5 22:03
牧生 发表于 2022-12-5 21:27
我只晓得f3和f4序参数,挺方便

能给个相关介绍的博文或者文献吗 谢谢老师
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牧生    时间: 2022-12-6 08:48
wangyueda 发表于 2022-12-5 22:03
能给个相关介绍的博文或者文献吗 谢谢老师

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Lacrimosa    时间: 2022-12-7 09:41
描述有序性的参数很多,水以及冰中常用的有tetrahedrality order parameters,bond order parameters,chill+等方法,其中第一个可以直接用gmx hydrorder计算,第二个可以通过pyscal.py计算,最后一个可能需要自己写程序。近年也有很多新的方法被开发出来,看这篇综述可以大概了解一下:Revealing key structural features
hidden in liquids and glasses




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