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标题: Ubuntu下使用ifort编译config不识别的解决方案 [打印本页]

作者
Author: snljty2 时间: 2022-12-6 15:53
标题: Ubuntu下使用ifort编译config不识别的解决方案
Ubuntu 20.04
2021-R2，已加载Intel OneAPI compiler和Intel OneAPI MKL。之前在./config步提示输入编译器的时候，输入ifort总提示不识别，然后怎么改config等脚本都不行。

今天终于发现问题在于Ubuntu默认不带csh，而GAMESS-US安装需要csh。于是很多人都顺手

sudo apt install csh

复制代码

了。刚才

file `which csh`

复制代码

追下去看了一下，发现原来是Ubuntu下apt install csh装的c-shell是BSD的，而CentOS等都是GNU的，有大量BSD不支持的GNU extensions，估计是GAMESS的编译用脚本里面哪里用了这些拓展。解决方案是

sudo apt remove csh
sudo apt install tcsh

复制代码

用tcsh代替BSD的csh，重新编译就没有问题了。

作者
Author: zjxitcc 时间: 2025-1-5 16:24
本帖最后由 zjxitcc 于 2025-1-5 16:26 编辑

这两天碰到一个集群上的所有子节点系统是Ubuntu，没有csh和tcsh，由于是集群上的子节点，个人运行sudo apt install tcsh不方便，于是我开始折腾自己编译tcsh。。。辛酸。简单记载过程如下，以便后人碰到类似问题可以查到

到如下两个网站上下载ncurses-6.1.tar.gz和tcsh-6.24.00.tar.gz压缩包
https://astron.com/pub/tcsh
https://ftp.gnu.org/gnu/ncurses
版本可以用更新的，但不建议更旧。

编译ncurses

tar -zxf ncurses-6.1.tar.gz
cd ncurses-6.1/
./configure --prefix=$HOME/software/ncurses6 --with-shared
make -j64
make install

复制代码

在个人~/.bashrc中写ncurses环境变量

export PATH=$HOME/software/ncurses6/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$HOME/software/ncurses6/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export CPATH=$HOME/software/ncurses6/include:$CPATH

复制代码

退出重登，使环境变量生效。接着编译tcsh

tar -zxf tcsh-6.24.00.tar.gz
cd tcsh-6.24.00/
mkdir build
cd build/
export LDFLAGS="-L$HOME/software/ncurses6/lib"
../configure --prefix=$HOME/software/tcsh6
make -j64
make install
ln -s $HOME/software/tcsh6/bin/tcsh $HOME/software/tcsh6/bin/csh

复制代码

注意中间有一行export LDFLAGS不要漏了。在个人~/.bashrc中写tcsh环境变量

export PATH=$HOME/software/tcsh6/bin:$PATH

复制代码

退出重登，使环境变量生效。运行

which csh

复制代码

发现已经有csh，并且在自己编译的路径下。打开gamess/rungms文件，将第一行

#!/bin/csh -f

复制代码

修改为

#!/public/home/jxzou/software/tcsh6/bin/csh -f

复制代码

注意，jxzou是我的用户名，具体路径请根据自己的用户名和安装路径修改。完成，可以在这系列子节点上使用GAMESS。

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