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标题: 求助分子力场拟合时improper项的处理 [打印本页]

作者
Author: wuyeyangguang 时间: 2022-12-6 20:49
标题: 求助分子力场拟合时improper项的处理
请教关于力场拟合时improper项的几个问题：
1. 优化后的平衡结构中如果存在中心原子及与之相连接的3个原子是共平面结构，那improper项是不是通常都要考虑。比如(NH2)OH整体平衡结构是一个平面，NH2O这个improper项是否必须要考虑。
2. 拟合二面角时，需要QM扫描能量减去无二面角扭转项的MM能量，这种情况下的MM能量应该是包含improper项吧？
3. 对于improper项的拟合，如果以“out-of-plane bend”概念，需要改变某个边缘原子的连接键与其他三个原子平面的夹角，那这个边缘原子是任意选的吗，对整体结构的影响怎么考虑
4. imprope项GIC柔性扫面的话，通过余弦/正弦函数找键、键垂直高度、键投影之间的几何关系，然后自己通过余弦值/正弦值对应相应的夹角，不知道是否可行。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-12-7 03:52
1 不是绝对要考虑。如果已有的二面角项已经足矣很好保持平面就不是必须得结合improper项

2 是

3、4 没必要拟合。improper项通常就是个谐振势维持平面或特定值，猜个数量级合适的力常数就够了。

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