计算化学公社

标题: 求助过渡态路径建模问题 [打印本页]

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wPV    时间: 2022-12-7 10:32
标题: 求助过渡态路径建模问题
求助:算过渡态时,建模只需要建路径那一段吗?计算也算路径那一段吗?不需要建完整的模型吗?

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含光君    时间: 2022-12-7 15:09
不知道你在说什么,如果你没有充分了解NEB和CI-NEB原理的话建议先看这部分资料。
然后参考大师兄科研网上的教程上机实践。 https://www.bigbrosci.com/2018/11/10/ex72/
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wPV    时间: 2022-12-7 16:42
含光君 发表于 2022-12-7 15:09
不知道你在说什么,如果你没有充分了解NEB和CI-NEB原理的话建议先看这部分资料。
然后参考大师兄科研网上 ...

我看过大师兄的文章,原子体系很小,跑的很快。如果体系有一万个原子,只计算一个原子的过渡态,这个原子只经过10个原子,我是在一万个体系里跑过渡态,还是截取这10个原子片段出来跑。
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含光君    时间: 2022-12-7 18:37
要考虑反应位点周边原子产生的影响,但也应该不至于要装一万个原子进去。
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wPV    时间: 2022-12-7 21:07
含光君 发表于 2022-12-7 18:37
要考虑反应位点周边原子产生的影响,但也应该不至于要装一万个原子进去。

谢谢,那我问一下,如何判断周边原子产生影响




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