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标题: Gaussian中Amber力场原子类型等参数确定 [打印本页]

作者
Author: xpyp 时间: 2016-6-1 10:45
标题: Gaussian中Amber力场原子类型等参数确定
Amber力场中，对于蛋白质等大分子，原子类型用大写字母表示，有机小分子用小写字母表示，用的是gaff参数。但在gaussian所举例的输入文件中，所有分子均用大写字母表示，是直接把小写字母改成大写就行吗？

用gview自动生成的文件中，其电荷可以用 antechamber来确定，但其它需输入的如： Hrmstr1 , HrmBnd等参数该如何获得呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-6-1 11:29
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=942
看4L后两个教程就明白了

作者
Author: 莉莉 时间: 2016-12-10 12:08

sobereva 发表于 2016-6-1 11:29
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=942
看4L后两个教程就明白了

老师，您好。我想请问一下4L指的是什么？就是看你给出的链接的那篇帖子里面提供的文献啊

作者
Author: sobereva 时间: 2016-12-10 14:04

莉莉发表于 2016-12-10 12:08
老师，您好。我想请问一下4L指的是什么？就是看你给出的链接的那篇帖子里面提供的文献啊

看链接里面4L的资料
那里面的资料足够了

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