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标题: 求助：如何求链与链之间的平均距离 [打印本页]

作者
Author: 乐平 时间: 2022-12-7 17:36
标题: 求助：如何求链与链之间的平均距离
各位好！目前我用 GFN2-xTB 优化得到了 3 条分子链相互作用的结构，如下图所示。希望用计算分子链两两之间的平均距离。请教各位应该如何求解？是否有这种功能的脚本呢？谢谢大家！

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作者
Author: chands 时间: 2022-12-7 20:10
你怎么定义两条链之间的平均距离？对应原子的距离的平均值吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-12-8 05:24
可以对A链每个原子都计算与B链原子最近距离，然后取个平均，作为平均距离。现成脚本应该没有，自己写一个很简单

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