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标题: 求助：关于gromacs统计数密度的问题 [打印本页]

作者
Author: Penson 时间: 2022-12-13 19:08
标题: 求助：关于gromacs统计数密度的问题
请问各位老师gromacs统计数密度的时候加-symm的作用是什么，为什么我加这个命令和不加统计出来的结果差别这么大呢？
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作者
Author: sobereva 时间: 2022-12-14 12:30
用于保证中心位置两侧的密度曲线是对称的，也即左右两侧曲线数据取平均。
当采样不够充分的情况，浓度本应对称的两部分的实际算出来的密度曲线会有所不同，-symm用来人为消除这个现象。

你的第一张图本来对称性就已经很好了，没必要用-symm。第二张图和第一张图差异很大，是你没用对-symm（大概率是中心位置没取对）。

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