计算化学公社

标题: g09B01/l1002.exe 错误 [打印本页]

作者
Author: 15whyhq 时间: 2016-6-2 12:51
标题: g09B01/l1002.exe 错误
这是输出和输入文件
l1002错误怎么解决？谢谢！

作者
Author: 冰释之川 时间: 2016-6-2 17:21
本帖最后由冰释之川于 2016-6-3 08:15 编辑

---------------------------- 楼主的输入-----------------------
#p opt=(calcfc,ts,maxcycle=500,noeigentest,tight) freq(noraman) b3pw91/6-31g(d,p) maxdisk=80GB iop(1/8=10) scf=maxcycle=500
-----------------------------------------------------------------

先谈谈令人发指的关键词书写：
（1）opt中的 maxcycle 一般不用设，maxcycle =XXX 很多情况下无助于处理问题；scf=maxcycle 也一样。
（2）freq 在DFT中默认就是 noraman，写它干甚？
（3）为什么要加iop(1/8=10) ?  IOp(1/8=N) 在优化的时候以N*0.01 bohr/弧度为最初置信半径，如果优化中不动态更新置信半径，则每一步步长都不会大于这个值（并非是必须等于这个值）。减小其数值有助于解决收敛震荡问题，如果势能面平缓，则应当加大以加快优化速度。默认是30。等价于opt关键词中maxstep选项。【如非必要，不要随意加iop】

下面讲讲正题：
NIJ > Max2 in MMCore.
Error termination via Lnk1e in /vol6/home/hn_zjl/software/Gaussion09/g09B01/l1002.exe
高斯官方给的答复是：

A memory allocation bug for very large systems, which could cause a failure with the message “NIJ > Max2 in MMCore,” was fixed
解决：换G09C01或更新的版本

-----------------建议先删去冗余关键词再开始计算-----------------------
#p b3pw91/6-31g(d,p) opt=(calcfc,ts,noeigentest) freq  maxdisk=80GB
--------------------------------------------------------------------------------
Update: 感谢四楼的提醒，加上calcfc

作者
Author: 15whyhq 时间: 2016-6-2 21:59
按照你给的关键词交了作业，都交不了作业，马上就结束了。
Error termination via Lnk1e in /public/software/Gaussian09/g09B01/l1.exe

作者
Author: nkallwar 时间: 2016-6-2 22:19

15whyhq 发表于 2016-6-2 21:59
按照你给的关键词交了作业，都交不了作业，马上就结束了。
Error termination via Lnk1e in /public/soft ...

他给的关键词里 opt=（ts，calcfc，noeigen）中漏写了calcfc ，这个是过渡态计算必须的

作者
Author: 15whyhq 时间: 2016-6-3 08:19

nkallwar 发表于 2016-6-2 22:19
他给的关键词里 opt=（ts，calcfc，noeigen）中漏写了calcfc ，这个是过渡态计算必须的

加上这个关键词后还是不行，交不上作业。
还有没有什么办法解决这个问题呀？

作者
Author: 冰释之川 时间: 2016-6-3 13:45

15whyhq 发表于 2016-6-3 08:19
加上这个关键词后还是不行，交不上作业。
还有没有什么办法解决这个问题呀？

贴出输出文件信息

作者
Author: 15whyhq 时间: 2016-6-4 09:08

冰释之川发表于 2016-6-3 13:45
贴出输出文件信息

这是你给的关键词后的输出文件

作者
Author: 冰释之川 时间: 2016-6-4 09:44

15whyhq 发表于 2016-6-4 09:08
这是你给的关键词后的输出文件

opt=(ts，calcfc，no

请用英文输入法打入“,” 不要直接复制！

作者
Author: 15whyhq 时间: 2016-6-5 16:02
恩，按照这个关键词还是同样的错误，而且更改g09版本行不通，还有没有其它的办法解决这个问题？谢谢！
这是输出文件

作者
Author: sobereva 时间: 2016-6-5 16:36

15whyhq 发表于 2016-6-5 16:02
恩，按照这个关键词还是同样的错误，而且更改g09版本行不通，还有没有其它的办法解决这个问题？谢谢！
这 ...

12核机子才给800MB内存？太小了！
能给多大给多大，还有这个问题传上D.01版的输出文件。

作者
Author: bomsaude 时间: 2016-6-6 03:31
过渡态我也不怎么懂，就是看了ExpChem2和3上的一些例子，但看到象你这样的体系，这过渡态初猜是怎么得到的？我感觉这也太困难了吧？
(, 下载次数 Times of downloads: 59)

作者
Author: 15whyhq 时间: 2016-6-6 08:40

sobereva 发表于 2016-6-5 16:36
12核机子才给800MB内存？太小了！
能给多大给多大，还有这个问题传上D.01版的输出文件。

内存的设置是根据什么来设定的？
设多大又是根据什么，我从哪里可以知道我可以给多大设多大？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-6-6 09:46

15whyhq 发表于 2016-6-6 08:40
内存的设置是根据什么来设定的？
设多大又是根据什么，我从哪里可以知道我可以给多大设多大？

机子有多少物理内存总应该知道
不知道就用top来看
如果没跑其它任务就留3G给系统，其它都给高斯

作者
Author: 15whyhq 时间: 2016-6-6 15:44

sobereva 发表于 2016-6-6 09:46
机子有多少物理内存总应该知道
不知道就用top来看
如果没跑其它任务就留3G给系统，其它都给高斯

这是我机子的物理内存，我应该设多大？没跑其它任务

作者
Author: KiritsuguPapa 时间: 2016-6-6 15:49

15whyhq 发表于 2016-6-6 15:44
这是我机子的物理内存，我应该设多大？没跑其它任务

32032M 31个G多给上十几二十个G都没有关系的……为什么只给人家800M……

作者
Author: 15whyhq 时间: 2016-6-6 16:40

KiritsuguPapa 发表于 2016-6-6 15:49
32032M 31个G多给上十几二十个G都没有关系的……为什么只给人家800M……

你说的意思是把%mem=100MW改的更大吗？改成%mem=20G？
还是说把maxdisk=100GB改大？

作者
Author: 冰释之川 时间: 2016-6-6 19:24

15whyhq 发表于 2016-6-6 16:40
你说的意思是把%mem=100MW改的更大吗？改成%mem=20G？
还是说把maxdisk=100GB改大？

%mem=20G

作者
Author: sobereva 时间: 2016-6-7 05:25

15whyhq 发表于 2016-6-6 16:40
你说的意思是把%mem=100MW改的更大吗？改成%mem=20G？
还是说把maxdisk=100GB改大？

%mem=26GB

作者
Author: 15whyhq 时间: 2016-6-7 21:49

sobereva 发表于 2016-6-6 09:46
机子有多少物理内存总应该知道
不知道就用top来看
如果没跑其它任务就留3G给系统，其它都给高斯

机子还算着其他的东西，我应该怎么设置内存？这是另一机子的内存
在这里还有其他人要算作业

作者
Author: sobereva 时间: 2016-6-8 05:10

15whyhq 发表于 2016-6-7 21:49
机子还算着其他的东西，我应该怎么设置内存？这是另一机子的内存
在这里还有其他人要算作业

当前根本没有别人在算。假设有，肯定%CPU会较高，给相应任务分配的内存（%MEM）也有一定数值。当前机子空着，机子有64GB内存，你设60GB都没问题。

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