计算化学公社

标题: 掺氮石墨吸附污染物分析问题 [打印本页]

作者
Author: 段家康 时间: 2022-12-16 23:54
标题: 掺氮石墨吸附污染物分析问题
我在计算掺氮石墨烯吸附污染物时遇到了一点问题，下面是我的计算过程。首先，我我设计了图一构型去吸附污染物，但是结果磺酸基团并不能够和H-N形成H键。吸附能为-21.13KJ/mol，
。然我将掺氮石墨烯构型中空缺变大，也就是图二，发现了磺酸基团能与H-N 形成氢键了，吸附能为-60.31KJ/mol。我的问题：为什么空缺小时，不能形成H键。空缺变大就可以。最后是我的计算基组：# opt freq b3lyp/6-31g(d,p) scrf=(solvent=water) em=gd3bj。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-12-17 04:22
第二个模型不合理，有碳自由基，实际吸附污染物的时候碰到点氧气啥的就反应掉了，不可能稳定存在。

作者
Author: 段家康 时间: 2022-12-17 23:22

wzkchem5 发表于 2022-12-17 04:22
第二个模型不合理，有碳自由基，实际吸附污染物的时候碰到点氧气啥的就反应掉了，不可能稳定存在。

谢谢老师

作者
Author: sobereva 时间: 2022-12-18 11:06
要对氢键的几何特征有点基本的了解，氢键是有一定方向性的，氢键键角偏离直线巨大的氢键必定很弱。如果由于结构原因注定没法形成键角合适的氢键的话，比如你的第一张图的情况，就别指望能形成氢键了。根本连试算都不用试。

作者
Author: 段家康 时间: 2022-12-18 12:07

sobereva 发表于 2022-12-18 11:06
要对氢键的几何特征有点基本的了解，氢键是有一定方向性的，氢键键角偏离直线巨大的氢键必定很弱。如果由于 ...

谢谢卢老师

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