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标题: 求助:MD是否能表现出离子的不同浓度(例如Na+,Cl-)对蛋白构象的影响? [打印本页]

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z9527567    时间: 2022-12-18 20:18
标题: 求助:MD是否能表现出离子的不同浓度(例如Na+,Cl-)对蛋白构象的影响?
没探究过具体的公式,请问MD离子与蛋白之间的相互作用会计算吗?
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sobereva    时间: 2022-12-19 09:33
通过动力学模拟自然而然就能体现,不需要特意考虑什么额外的相互作用。根据力场公式,游离的离子和蛋白的非键相互作用显然会体现出来
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z9527567    时间: 2022-12-20 17:02
sobereva 发表于 2022-12-19 09:33
通过动力学模拟自然而然就能体现,不需要特意考虑什么额外的相互作用。根据力场公式,游离的离子和蛋白的非 ...

好的明白了,谢谢sob老师。




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