计算化学公社

标题: 求助:速度自相关函数趋向于0的速度的问题 [打印本页]

作者
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MZTNXWXBCLA    时间: 2022-12-19 18:47
标题: 求助:速度自相关函数趋向于0的速度的问题
文献中是一个n-C7H16 - N2体系,速度自相关函数在2000ps的时候到了0,我自己用GROMACS跑了下,发现速度自相关函数很快就到了0.09,但是趋向于0的速度很慢,请问是什么原因导致了这种差异呢?是因为压力吗?这篇文献中我都没有看到有关预平衡的步骤,而且还跑了nve。感觉有些奇怪
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qiyan    时间: 2023-2-28 10:00
请问一下gromacs里计算vacf的命令是什么啊
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Lacrimosa    时间: 2023-2-28 13:34
qiyan 发表于 2023-2-28 10:00
请问一下gromacs里计算vacf的命令是什么啊

手册里一搜便知,gmx velacc




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