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标题: 存在单糖修饰的N-糖基化修饰？ [打印本页]

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Author: Mimizi 时间: 2022-12-21 21:13
标题: 存在单糖修饰的N-糖基化修饰？
本帖最后由 Mimizi 于 2022-12-21 21:28 编辑

请教各位老师存在单糖修饰的蛋白吗？我的蛋白前期预测没有糖基化修饰，但是晶体解析后的结构发现连接了3个N-乙酰葡萄糖胺。在tleap的时候我发现糖基的“NAG”标识不能被识别（图1），查了一下资料是需要和Glycam上的符号一致（图2），想问一下这一步只要糖基的名字改成0VB,还是原子名称、序号都需要一致呀？（尝试了将GLycam上的结构替换蛋白上原有的糖基，但是两个结构不能完全重叠）如果实际上蛋白不是由N-乙酰葡萄糖胺进行单糖修饰而是由寡糖修饰由如何确定具体是什么寡糖呢？

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