计算化学公社

标题: 关于Hirshfield表面分析问题 [打印本页]

作者
Author: a-Student 时间: 2022-12-23 20:13
标题: 关于Hirshfield表面分析问题
本帖最后由 a-Student 于 2023-1-2 21:54 编辑

老师，打扰您一下，读到帖子请问hirshfeld表面分析求解不同类型作用的比例问题 - 波函数分析与Multiwfn (Wavefunction Analysis & Multiwfn) - 计算化学公社 (keinsci.com)我也想做如图中心分子与周围分子或原子之间相互作用类型占比，想做晶体结构的，中心分子与周围分子存在C-H...S 或者C-H...pi氢键相互作用所占比，请问老师如何进行性分析呢，请老师指点或推荐相关博文。谢谢您

作者
Author: sobereva 时间: 2022-12-23 21:40
仔细看Multiwfn手册4.12.6节的Hirshfeld surface分析的例子

作者
Author: a-Student 时间: 2022-12-24 19:49
本帖最后由 a-Student 于 2023-1-2 21:54 编辑

sobereva 发表于 2022-12-23 21:40
仔细看Multiwfn手册4.12.6节的Hirshfeld surface分析的例子

谢谢您，再次请教您，我画hirshfield表面发现如图位置没有氢键的迹象呢，请问老师是hirshfield表面方法无法表现我这个体系中心分子与周围分子的相互作用类型么？我已上传hirshfield表面文件，文件太大所以上传到网盘里，辛苦您帮我看下是否正确，麻烦老师啦，谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2022-12-26 00:10

a-Student 发表于 2022-12-24 19:49
谢谢您，再次请教您，我画hirshfield表面发现如图位置没有氢键的迹象呢，请问老师是hirshfield表面方法无 ...

C-H是极弱的氢键给体，硫是较弱的氢键受体，凭常识就知道这氢键巨弱。你的图上那部分接触区域稍微有点白色，已经显现出这有极弱的氢键作用了，非常正常

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)