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标题: 使用Autodock vina1.2.3进行大环分子对接时环不能闭合该怎么处理? [打印本页]

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LiuSX    时间: 2022-12-24 22:39
标题: 使用Autodock vina1.2.3进行大环分子对接时环不能闭合该怎么处理?
本帖最后由 LiuSX 于 2022-12-25 18:36 编辑

如标题所说,我在使用vina的大环分子(macrocycles)对接功能时遇到问题,对接输出的各个model的环都没有闭合,如图中所示(受体被隐去),两个孤零零的虚原子相隔很远。请问该怎么处理这种情况?
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喵星大佬    时间: 2022-12-25 14:49
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LiuSX    时间: 2022-12-25 18:37
喵星大佬 发表于 2022-12-25 14:49
上传配体的pdbqt文件

老师你好,我已经上传了,麻烦看看能否给点建议
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DSMelody    时间: 2023-6-13 21:16
在官方文档周似乎有相关说明,可以试试看行不行
https://autodock-vina.readthedoc ... ing_macrocycle.html




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