计算化学公社

标题: ORCA的溶剂模型;ORCA不同版本能否共存 [打印本页]

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火车头    时间: 2022-12-27 18:00
标题: ORCA的溶剂模型;ORCA不同版本能否共存
本帖最后由 火车头 于 2022-12-27 18:53 编辑

请教一下大佬们:1)我想用orca算穆斯堡尔谱,文献作了参数拟合,当时17年的文献使用orca3.0.3,cosmo溶剂模型。但是我现在安装了orca5.0.3里面用不了cosmo关键词,但是手册里写用CPCMC关键词可以使用COSMO epsilon function,不知道这和之前版本的COSMO关键词效果是不是一样的?或者说,能否在ORCA5.0.3上实现ORCA3.0.3的COSMO关键词完全一样的效果?
2)一个集群上能否同时安装运行两个版本的ORCA?在有ORCA5.0.3的基础上,我又补装了ORCA3.0.3(搭配openmpi165),但是这一版无法通过测试,卡住不算了。不知道是不是因为两个版本不能同时计算



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火车头    时间: 2022-12-27 18:57
更新:改成单核测试成功了,多核不行
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sobereva    时间: 2022-12-28 03:26
你可以按ORCA手册里说的用CPCMC(solvent),和3.0.3的COSMO做个对比,如果差异不可忽略那就只能用3.0.3了
3.0.x和5.0.x对OpenMPI版本要求明显不同,没法俩同时使用
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火车头    时间: 2022-12-28 09:19
sobereva 发表于 2022-12-28 03:26
你可以按ORCA手册里说的用CPCMC(solvent),和3.0.3的COSMO做个对比,如果差异不可忽略那就只能用3.0.3了
3 ...

现在的问题就是,我装了3.0.3没法并行计算,但是我和文献对比感觉是差的挺远的;关于两个openmpi版本,我用pbs提交任务,环境变量在pbs里定义按理说是不是也是可以的?
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sobereva    时间: 2022-12-29 03:02
火车头 发表于 2022-12-28 09:19
现在的问题就是,我装了3.0.3没法并行计算,但是我和文献对比感觉是差的挺远的;关于两个openmpi版本,我 ...

让3.0.3标配的OpenMPI版本处于激活状态
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beefly    时间: 2022-12-29 05:58
本帖最后由 beefly 于 2022-12-29 06:02 编辑

COSMO和CPCM、CPCMC对芯电子性质的影响差不多,不用刻意区分。需要注意的一点是,在3.0版本中,如果def2基组(如def2-TZVP)与相对论哈密顿ZORA、DKH(还有精度高于ZORA的IORA,但用的比较少)搭配,ORCA用的并不是def2-TZVP基组,而是在程序内部改成了ZORA/DKH-def2-TZVP。一些论文作者没注意这点,说自己用的是def2基组,但是用ORCA高版本重复不出结果,就说是CPCMC溶剂模型不好。其实,ZORA/DKH-def2与def2的芯电子性质差距很大,原始的def2结果比较差。在后来的ORCA版本中,程序不会擅自修改基组,用户必须明确指定def2或ZORA/DKH-def2,这样两个版本得到的芯电子性质就有可比性了。

我机器上的ORCA 3.0和5.0版本共用同一版本的OpenMPI,没遇到运行问题。
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火车头    时间: 2022-12-29 10:00
本帖最后由 火车头 于 2022-12-29 10:04 编辑
sobereva 发表于 2022-12-29 03:02
让3.0.3标配的OpenMPI版本处于激活状态

谢谢社长,已经解决!我记得上次自己在帖子下补充说明已经解决了,但好像没发出来。
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火车头    时间: 2022-12-29 10:03
本帖最后由 火车头 于 2022-12-29 10:09 编辑
beefly 发表于 2022-12-29 05:58
COSMO和CPCM、CPCMC对芯电子性质的影响差不多,不用刻意区分。需要注意的一点是,在3.0版本中,如果def2基 ...

大佬一语中的,用的正是def2-TZVP基组搭配ZORA,ORCA5.0.3算出来的结果和3.0.3差的很多,原来是这个原因!我的两个版本也成功运行了(使用各自版本的openmpi,用pbs脚本定义环境变量,提交到不同节点上,同一节点还没试过),现在没有问题。




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