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标题: 如何使用PyMOL产生蛋白在溶液中的静电势能图？ [打印本页]

作者
Author: yy_ds_yyds 时间: 2022-12-27 18:56
标题: 如何使用PyMOL产生蛋白在溶液中的静电势能图？
求助！！！！
PyMol提供的通用方法是在真空而不是溶剂中计算静电势能图。
那么如何使用更复杂的模型计算静电势能图，考虑溶剂和溶液（适当的[NaCl]）中的电荷效应。
PyMol可以么？如果可以的话，请问该怎么做？
如果不可以，请问什么软件或者网站可以？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-12-28 03:29
PDB2PQR在线服务器（http://server.poissonboltzmann.org/pdb2pqr）里结合APBS可以直接给出考虑PB隐式溶剂模型情况的蛋白质表面静电势

作者
Author: yy_ds_yyds 时间: 2022-12-28 14:07

sobereva 发表于 2022-12-28 03:29
PDB2PQR在线服务器（http://server.poissonboltzmann.org/pdb2pqr）里结合APBS可以直接给出考虑PB隐式溶剂 ...

谢谢老师回复

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