计算化学公社
标题:
请教如何使用Multiwfn如何分析轨迹文件较大的aNCI,对轨迹文件进行适当的处理
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作者Author:
sxj886
时间:
2022-12-28 22:47
标题:
请教如何使用Multiwfn如何分析轨迹文件较大的aNCI,对轨迹文件进行适当的处理
最近要进行数据的解析,但是在弱相互作用分析这里遇到一些问题,比较头疼。在分析弱相互作用时,导入Multiwfn的轨迹文件不可以太大,一般大概就几百mb左右的文件,Multiwfn才可以分析,过大就会直接退出Multiwfn也就是会报错,或程序崩溃。但是我做的分子动力学模拟得到的轨迹文件大概都是40个G大小甚至更大,即便将其轨迹压缩至1个G左右大小,但还是无法使用Multiwfn进行分析(压缩至300mb左右,在试格点数的过程中,可以进行计算,但是计算的速度非常之慢,达到无法接受的速度,一直在0.2%不会变化,并且该文件仅有100帧,完全不符合aNCI 1000帧以上的建议),压缩至太小又会导致文件所含帧数太少,无法起到aNCI分析的效果。请问大家有什么好的方法处理轨迹文件,或者可以在Multiwfn中用一些其他的操作避免这样的问题吗?十分感谢各位老师!
作者Author:
sobereva
时间:
2022-12-29 02:35
先说清楚当前的机子硬件,尤其是物理内存,以及操作系统、Multiwfn的更新日期
Multiwfn的这个功能根本没有 “一般大概就几百mb左右的文件”这种限制
体系特征也说清楚,交代清楚原子数,至少截个图说清楚aNCI分析的是什么区域,XYZ方向格点数各是多少
仔细看
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620
(
http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html
)
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