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标题: DFT-D3M：改进DFT-D3在平衡距离内结果精度 [打印本页]

作者
Author: sobereva 时间: 2016-6-5 08:32
标题: DFT-D3M：改进DFT-D3在平衡距离内结果精度
J. Phys. Chem. Lett. 2016, 7, 2197−2203
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原先DFT-D3、D3(BJ)在拟合参数时对平衡距离以内的情况考虑不足，导致显著小于平衡距离结构下的弱相互作用计算误差明显大于平衡结构附近或远距离的情况。
此文提出了DFT-D3M、D3M(BJ)，M意指modified，专门用大量小于平衡距离的结构做训练集来重新拟合DFT-D3、D3(BJ)参数，使近程计算误差减小了一半。
已拟合B2PLYP、B3LYP、BLYP、PBE等泛函的参数，其中B3LYP-D3M(BJ)最为划算。文中补充材料包含用于做D3M的修改版DFT-D3程序。

作者
Author: 北纬18° 时间: 2016-6-5 10:51
不知道gaussian什么时候能支持

作者
Author: yflchx 时间: 2016-6-5 14:24
本帖最后由 yflchx 于 2016-6-5 14:30 编辑

北纬18° 发表于 2016-6-5 10:51
不知道gaussian什么时候能支持

初略看了一下，D3M(BJ)好像只是改了D3(BJ)的参数。

如果用的话，使用论文中给出的新参数就行。

看的不仔细，如果我说的不对，烦请告知。

我想论文解决的是short-range和long-range的衔接问题。

作者
Author: plus 时间: 2016-6-5 17:00
之前用D3算二硫键的二面角差的有点多，试试这个

作者
Author: 北纬18° 时间: 2016-6-5 20:21
B3LYP-D3(BJ) 和 B3LYP-D3M(BJ) 能量竟然相差 2.1 kcal/mol !

作者
Author: 北纬18° 时间: 2016-6-6 01:23
可惜没有m06系列的参数

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-6-6 11:11

北纬18° 发表于 2016-6-5 20:21
B3LYP-D3(BJ) 和 B3LYP-D3M(BJ) 能量竟然相差 2.1 kcal/mol !

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SI里给出的对结合能的修正量即使在近程也在0.X kcal/mol的量级，正常的分子间作用力距离都在 0.1 kcal/mol 以下；你说的差 2.1 kcal/mol 明显有问题

作者
Author: 北纬18° 时间: 2016-6-6 12:23

liyuanhe211 发表于 2016-6-6 11:11
SI里给出的对结合能的修正量即使在近程也在0.X kcal/mol的量级，正常的分子间作用力距离都在 0.1 kca ...

比较方法有问题

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