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标题: 求助在MS中使用粗粒化模块中NVT模拟后，原子轨迹都跑出盒子了 [打印本页]

作者
Author: sunyingtao 时间: 2023-1-4 15:08
标题: 求助在MS中使用粗粒化模块中NVT模拟后，原子轨迹都跑出盒子了
求助！各位老师好，我想要使用MS软件中的粗粒化模块进行模拟，在进行结构优化后，进行NVT系综模拟后，输出的轨迹文件中原子都在盒子外，请问该如何处理啊，谢谢！（所选用的力场是经过Blend模块计算后的相互作用参数）
下图1为结构优化后的图，图二为NVT系综下原子轨迹其中一帧的图：
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作者
Author: sobereva 时间: 2023-1-4 22:35
帖子标题不得乱用叹号，置顶的新社员必读贴以及http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html都明确说了。这次给你改了，下次乱用叹号直接删帖扣分处理。

作者
Author: sunyingtao 时间: 2023-1-6 14:20

sobereva 发表于 2023-1-4 22:35
帖子标题不得乱用叹号，置顶的新社员必读贴以及http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html都明确说了。 ...

谢谢，我了解了

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